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龙图腾网获悉中国海洋大学申请的专利一种精确预测微生物发酵过程中底物蛋白质水解位点的方法获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN120126556B 。

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-10-21发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202510298179.1，技术领域涉及：G16B20/30；该发明授权一种精确预测微生物发酵过程中底物蛋白质水解位点的方法是由王皓;马帅;刘晴雯;李振兴设计研发完成，并于2025-03-13向国家知识产权局提交的专利申请。

本一种精确预测微生物发酵过程中底物蛋白质水解位点的方法在说明书摘要公布了：本发明提供了一种精确预测微生物发酵过程中底物蛋白质水解位点的方法，属于分子生物学技术领域。本发明基于全基因组数据并使用生物信息学手段筛选出目标微生物分泌的蛋白酶；建立所述目标微生物蛋白酶的三维结构模型；将目标微生物蛋白酶与底物蛋白质进行分子对接以获得最佳对接构象；采用分子动力学模拟研究目标微生物蛋白酶和底物蛋白质在发酵条件下的相互作用关系；分析分子对接和分子动力学模拟结果，预测微生物发酵过程中底物蛋白质的水解位点。本发明利用分子对接和分子动力学模拟，能够准确预测微生物发酵过程中酶和底物蛋白质结合的位点，同时对发酵后的蛋白质底物产生多肽情况进行分析，能够借此靶向定位水解出特定多肽的微生物蛋白酶。

本发明授权一种精确预测微生物发酵过程中底物蛋白质水解位点的方法在权利要求书中公布了：1.一种精确预测微生物发酵过程中底物蛋白质水解位点的方法，其特征在于，包括以下步骤： 1将目标微生物的全基因组数据通过生物信息学手段转录、翻译成蛋白质氨基酸序列；将所述蛋白质氨基酸序列与已知的同源微生物蛋白酶进行同源性对比，筛选出目标微生物分泌的蛋白酶； 2利用建模软件，建立所述目标微生物分泌的蛋白酶的三维结构模型； 3结合底物蛋白质的结构，挑选其中可能为结合位点的氨基酸残基，将目标微生物分泌的蛋白酶与底物蛋白质进行分子对接以获得最佳对接构象； 4采用分子动力学模拟研究目标微生物分泌的蛋白酶和底物蛋白质在发酵条件下的相互作用关系； 5分析分子对接和分子动力学模拟的结果，预测微生物发酵过程中底物蛋白质的水解位点； 所述目标微生物为瑞士乳杆菌Lh191404，所述蛋白酶为胞壁蛋白酶，所述底物蛋白质为大西洋鳕鱼小清蛋白过敏原Gadm1； 将胞壁蛋白酶的PR结构域定义为受体，大西洋鳕鱼小清蛋白过敏原Gadm1定义为配体，将这5条肽段AA1-8、AA19-26、AA52-60、AA72-79、AA91-99分别设置为BindingSiteResidues，AngularStepSize设置为6°。

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