大连海事大学马宝山获国家专利权
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龙图腾网获悉大连海事大学申请的专利一种结合信息论和机器学习的基因调控网络推断方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN115188416B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-11-04发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202210891209.6,技术领域涉及:G16B30/00;该发明授权一种结合信息论和机器学习的基因调控网络推断方法是由马宝山;钱冰;梁沛霖;陈护升;吉嘉琦;陈嘉煦设计研发完成,并于2022-07-27向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种结合信息论和机器学习的基因调控网络推断方法在说明书摘要公布了:本发明公开了一种结合信息论和机器学习的基因调控网络推断方法,包括获取不同基因表达过程的时间序列,将时间序列转换为符号序列,计算不同基因符号序列之间的符号转移熵,计算对各基因的调控基因集合,对靶基因的时间序列和其调控基因集合所对应的时间序列集合构建模型并进行训练,计算调控基因重要性分数,筛选重要性分数满足第一阈值的调控基因,将其加入核心调控基因集合中;获取所有核心调控基因对靶基因的符号转移熵,将核心调控基因的重要性分数和符号转移熵分别归一化后合并为调控系数,筛选满足第二阈值的核心调控基因集合,获取所有靶基因的核心调控基因集合。降低计算复杂度,解决基于机器学习的模型的过拟合问题,提高预测精度。
本发明授权一种结合信息论和机器学习的基因调控网络推断方法在权利要求书中公布了:1.一种结合信息论和机器学习的基因调控网络推断方法,其特征在于,包括 步骤一、获取不同基因表达过程的时间序列,分别将不同基因的时间序列转换为符号序列,获取不同基因的符号序列集合,分别计算不同基因符号序列之间的符号转移熵; 步骤二、计算对各基因具有调控作用的调控基因集合,包括令各基因轮流作为靶基因,除靶基因外的基因作为剩余基因集合,基于剩余基因集合中的基因对靶基因的符号转移熵值、靶基因对剩余基因集合中基因的符号转移熵值,判断剩余基因集合中的基因是否对靶基因具有调控作用,若具有调控作用,则将具有调控的基因加入至靶基因的调控基因集合中,获取各基因的调控基因集合; 步骤三、对于任意靶基因及其调控基因集合,构建靶基因的时间序列和其调控基因集合所对应的时间序列集合之间的关系,对所述关系构建CatBoost模型并进行训练,计算每次训练过程所有调控基因作为模型中叶子结点的次数,将次数作为调控基因的重要性分数,根据重要性分数排序,删除重要性分数不满足第一阈值的调控基因,将剩余的调控基因加入核心调控基因集合中,将核心调控基因集合中的核心调控基因的重要性分数做归一化处理; 步骤四、获取所有核心调控基因对靶基因的符号转移熵,并进行归一化处理,将核心调控基因归一化后的重要性分数和符号转移熵合并为调控系数,当核心调控基因的调控系数不满足第二阈值时,删除该核心调控基因,获取靶基因的核心调控基因集合; 步骤五、重复执行步骤三、步骤四,直到获取所有靶基因的核心调控基因集合。
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