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龙图腾网获悉安徽大学申请的专利基于深层有向图卷积的基因网络调控关系的重构方法获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN119229958B 。

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-11-04发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202411316427.2，技术领域涉及：G16B20/00；该发明授权基于深层有向图卷积的基因网络调控关系的重构方法是由魏丕静;丁正;丁云;曹瑞芬;郑春厚设计研发完成，并于2024-09-20向国家知识产权局提交的专利申请。

本基于深层有向图卷积的基因网络调控关系的重构方法在说明书摘要公布了：本发明公开了一种基于深层有向图卷积的基因网络调控关系的重构方法，包括：1、使用Node2Vec方法获取酿酒酵母菌基因调控网络的拓扑信息；2、对于酿酒酵母菌因调控网络使用图数据增强手段，获得更高效的信息表达；3、对于酿酒酵母菌基因调控网络的调控方向问题，使用有向图神经网络的预测调控关系方向信息；4、构建深层有向图卷积模型，获取基因高阶的邻居信息；5、将酿酒酵母菌基因的表达特征和步骤1、2中得到的特征进行拼接后输入到模型中得到酿酒酵母菌调控网络预测分数矩阵，根据预测分数矩阵和阈值之间的关系，判断基因间是否存在调控关系。本发明能准确预测酿酒酵母菌基因间的调控关系，有助于更高效地研究生物体生化反应的本质。

本发明授权基于深层有向图卷积的基因网络调控关系的重构方法在权利要求书中公布了：1.一种基于深层有向图卷积的基因网络调控关系的重构方法，其特征在于，包括如下步骤： 步骤1、获取酿酒酵母菌基因网络，其中，V是酿酒酵母菌基因节点集合，且，表示第n个酿酒酵母菌基因节点；表示酿酒酵母菌基因节点的总数，E表示各个酿酒酵母菌基因节点之间的调控关系所形成的有向边集合，且；表示第条有向边，表示有向边的总数，并由E得到维度为N×N的邻接矩阵； 获取的M维基因表达谱，从而由N个酿酒酵母菌基因节点的M维基因表达谱构成维度为N×M的表达谱矩阵； 步骤2、构建邻域增强网络，并用于对和进行处理，得到增强特征； 步骤3、将输入到Node2Vec模型中，通过邻域采样策略生成的网络邻域，再利用随机游走的方式对的网络邻域进行遍历，得到1×T维的的拓扑信息嵌入；从而得到N个酿酒酵母菌基因节点的拓扑信息嵌入并组成N×T维的网络拓扑信息嵌入矩阵F；其中，T表示每个基因的最终表示维度； 步骤4、将与拼接后，得到维度为的特征矩阵，并与一起输入到特征融合模块中进行处理，从而利用式1得到融合特征矩阵B： 1 式1中，表示消息传播形式，表示正则化，表示拼接，表示信息学习权重矩阵； 步骤5：构建有向图卷积神经网络，并对A、B和进行处理，得到调控关系预测分数矩阵； 步骤6：利用随机梯度下降法对所述有向图卷积神经网络进行训练，并计算交叉熵损失函数以更新网络参数，直到交叉熵损失函数收敛为止，从而得到训练好的酿酒酵母菌基因调控网络推理模型，用于输出基因之间存在调控关系的预测分数，并通过设定的阈值最终判定是否存在有向调控关系。

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