浙大城市学院刘泓获国家专利权
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龙图腾网获悉浙大城市学院申请的专利基于深度双曲流形嵌入的细胞分化轨迹推断方法获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN119479828B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-11-04发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202510044838.9，技术领域涉及：G16B40/00；该发明授权基于深度双曲流形嵌入的细胞分化轨迹推断方法是由刘泓;邱秀秀;臧泽林设计研发完成，并于2025-01-13向国家知识产权局提交的专利申请。
本基于深度双曲流形嵌入的细胞分化轨迹推断方法在说明书摘要公布了：本发明涉及基于深度双曲流形嵌入的细胞分化轨迹推断方法，包括：获取单细胞RNA测序数据；引入负曲率的双曲空间嵌入，通过深度特征提取网络对所述单细胞RNA测序数据进行特征提取，并将提取的高维特征映射到低维双曲空间；通过低维双曲空间中的轨迹推断，构建细胞从祖细胞到各分化终末细胞类型的转变路径，并利用敏感性分析方法评估关键基因和通路。本发明的有益效果是：本发明通过引入负曲率的双曲空间嵌入，模型能够更好地捕捉数据的层次结构，增强分化轨迹的准确性和一致性。并且，本发明能够处理高维单细胞测序数据，克服传统方法在高维情况下的局限性，提升模型的适用性。
本发明授权基于深度双曲流形嵌入的细胞分化轨迹推断方法在权利要求书中公布了：1.基于深度双曲流形嵌入的细胞分化轨迹推断方法，其特征在于，包括： 步骤1、获取单细胞RNA测序数据； 步骤2、引入负曲率的双曲空间嵌入，通过深度特征提取网络对所述单细胞RNA测序数据进行特征提取，并将提取的高维特征映射到低维双曲空间；步骤2中，所述深度特征提取网络由多个全连接层和激活函数组成；所述深度特征提取网络的最后一层由双曲映射层和双曲激活函数组成； 步骤3、通过低维双曲空间中的轨迹推断，构建细胞从祖细胞到各分化终末细胞类型的转变路径，并利用敏感性分析方法评估关键基因和通路； 步骤3包括： 步骤3.1、计算细胞间的双曲距离； 步骤3.2、根据所述细胞间的双曲距离，使用层次聚类算法构建细胞分化树，明确细胞从祖细胞到各分化终末细胞类型的转变路径； 步骤3.3、利用敏感性分析方法，对双曲空间中的轨迹进行扰动，识别在分化过程中起关键作用的基因和信号通路； 步骤3.3的计算公式为： 其中，表示基因对分化轨迹的敏感性。
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