厦门大学董继扬获国家专利权
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龙图腾网获悉厦门大学申请的专利一种基于局部相似性的代谢组学样本归一化方法及系统获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119598198B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-11-07发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202411681323.1,技术领域涉及:G06F18/214;该发明授权一种基于局部相似性的代谢组学样本归一化方法及系统是由董继扬;陆可懿;郭凡靖;邓伶莉设计研发完成,并于2024-11-22向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种基于局部相似性的代谢组学样本归一化方法及系统在说明书摘要公布了:本发明公开了一种基于局部相似性的代谢组学样本归一化方法及系统,方法包括:初始化步骤,给定待归一化的代谢组学数据矩阵并初始化样本的归一化系数;投影步骤,将数据矩阵投影到主成分分析子空间中,得到投影数据矩阵;最近邻集构建步骤,利用数据矩阵计算任意两个样本之间的相关性,并利用投影数据矩阵计算任意两个样本之间的距离,根据相关性和距离指标得到每个样本的最近邻集;样本归一化步骤,计算样本向量的归一化系数,得到归一化组成新的数据矩阵;迭代步骤,迭代子空间投影步骤至样本归一化步骤,直至归一化数据矩阵的相对变化量小于给定阈值。本发明保留了数据的局部结构,同时矫正稀释效应,使样本数据之间具有更好的可比性。
本发明授权一种基于局部相似性的代谢组学样本归一化方法及系统在权利要求书中公布了:1.一种基于局部相似性的代谢组学样本归一化方法,其特征在于,包括如下步骤: 参数初始化步骤,给定待归一化的代谢组学数据矩阵为,其中,为样本数;为变量数,变量指代谢物;初始化样本的归一化系数;所述样本包括糖尿病患者和健康志愿者的唾液代谢谱; 子空间投影步骤,将数据矩阵投影到主成分分析子空间中,保留前个成分,得到投影后的数据矩阵; 最近邻集构建步骤,利用数据矩阵计算任意两个样本之间的相关性,并利用投影数据矩阵计算任意两个样本之间的距离,分别根据相关性和距离指标选取前K个样本,两者取并集得到每个样本的最近邻集; 样本归一化步骤,计算任意的样本向量的归一化系数,得到归一化组成新的数据矩阵;归一化后的数据与其最邻近集中的样本靠近; 算法迭代步骤,迭代子空间投影步骤至样本归一化步骤,直至归一化数据矩阵的相对变化量小于给定阈值;从而使得归一化后的样本在分类任务中保留更多与糖尿病相关的样本信息,提高不同组别数据的分离度; 所述样本归一化步骤,包括以下步骤: 根据最近邻集计算样本的参考谱; 计算样本与它的参考谱之间的商集,表示为: ; 将商集分为两个子集,表示为: ; 基于两个子集计算样本归一化系数为: ; 根据归一化系数更新数据矩阵,表示为: ; 所述根据最近邻集计算样本的参考谱,以中值谱作为参考谱,表示为: ; 其中,表示对最近邻集的每一个变量取中值。
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