中国人民解放军军事科学院军事医学研究院陈河兵获国家专利权
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龙图腾网获悉中国人民解放军军事科学院军事医学研究院申请的专利Hi-C文库测序潜力预测方法、装置、设备及存储介质获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN120727094B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-11-07发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202511233535.8,技术领域涉及:G16B20/30;该发明授权Hi-C文库测序潜力预测方法、装置、设备及存储介质是由陈河兵;林霖;杨现辉设计研发完成,并于2025-09-01向国家知识产权局提交的专利申请。
本Hi-C文库测序潜力预测方法、装置、设备及存储介质在说明书摘要公布了:本申请提供一种Hi‑C文库测序潜力预测方法、装置、设备及存储介质,涉及生物信息学技术领域,该方法包括:获取测序样本的片段对数据并分组得到多个分组数据;分别进行片段去重处理并统计有效片段数量;构建坐标数据;输入复杂度预测模型拟合模型参数,以预测预测文库复杂度。本申请提供的方法在不增加实验流程复杂度的基础上,提供了一种自动化、数据驱动的文库复杂度预测手段,可为实验人员在文库制备完成后是否继续追加测序提供量化依据,提升整体测序效率与资源配置效率,具有良好的实用性与推广前景。
本发明授权Hi-C文库测序潜力预测方法、装置、设备及存储介质在权利要求书中公布了:1.一种Hi-C文库测序潜力预测方法,其特征在于,包括: 获取测序样本的片段对数据,并对所述片段对数据分组,以模拟不同观测测序深度,得到多个分组数据,包括:获取测序样本的片段对数据,并对所述片段对数据根据片段起始位置进行排序,以恢复测序片段的原始分布顺序;对排序后的所述片段对数据进行分组累加,使每个分组中包含有固定数量的片段对,以得到多个用于模拟不同观测测序深度的所述分组数据;其中,所述分组累加是以并行计算方式进行,并基于预设的累加单位和分组数量执行; 对每个所述分组数据分别进行片段去重处理,并统计每个所述分组数据对应的有效片段数量,包括:对每个所述分组数据提取片段对记录的第二列、第三列、第五列和第六列的字段,作为字段组合信息;基于所述字段组合信息,对片段对记录进行去重,以识别并排除重复片段对;分别统计每个所述分组数据中的片段去重处理前的片段对数量,作为对应的观测测序深度;以及,片段去重处理后的片段对数量,作为对应的观测文库复杂度; 结合每个所述分组数据的观测测序深度及其对应的所述有效片段数量,构建所述观测测序深度与观测文库复杂度之间的坐标数据; 将所述坐标数据输入复杂度预测模型,利用机器学习算法拟合模型参数,以预测在目标测序深度下的预测文库复杂度;其中,所述复杂度预测模型的表达式为: ; 其中,x代表测序深度;y代表所述预测文库复杂度;m代表观测文库复杂度,a代表为通过机器学习算法拟合的样本特异性指数参数。
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