之江实验室陈高祥获国家专利权
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龙图腾网获悉之江实验室申请的专利基因大模型与ML联合鉴定Cas靶点有效性的方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN120636549B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-11-11发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202511131013.7,技术领域涉及:G16B40/00;该发明授权基因大模型与ML联合鉴定Cas靶点有效性的方法是由陈高祥;石军超;胡程鹏;张宁;冯琳清设计研发完成,并于2025-08-13向国家知识产权局提交的专利申请。
本基因大模型与ML联合鉴定Cas靶点有效性的方法在说明书摘要公布了:本发明公开了一种基因大模型与ML联合鉴定Cas靶点有效性的方法,属于生物技术和人工智能领域。方法包括:构建A种联合序列以及靶向联合序列的检测阵列,检测阵列具有A个检测单元;在每个检测单元中分别加入一种联合序列,进行孵育反应,获取各个检测单元的荧光值并进行归一化处理;对各联合序列采用特征提取模型进行关键特征提取;构建标签集和训练集,构建集成模型并采用标签集和训练集进行训练;将特征提取模型与训练好的集成模型组成机器学习模型;对于新的靶标序列和PAM序列,将其结合为待分析的联合序列,再输入机器学习模型,得到预测荧光值,基于荧光值判断Cas蛋白对联合序列的识别能力。本发明可助力靶向治疗检测。
本发明授权基因大模型与ML联合鉴定Cas靶点有效性的方法在权利要求书中公布了:1.一种基因大模型与ML联合鉴定Cas靶点有效性的方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤: 1选择N个Cas酶靶向结合区域,将其结合位置上与crRNA互补的核苷酸序列分别与M种不同组合的PAM序列结合,形成N×M种联合序列; 2构建靶向所述联合序列的检测阵列,所述检测阵列具有N×M个检测单元,每个检测单元均包括Cas蛋白、crRNA和荧光探针; 3在每个检测单元中分别加入一种联合序列,进行孵育反应;在检测单元内,Cas蛋白与crRNA以及联合序列形成三元复合体,三元复合体切割荧光探针,从而发出荧光,获取各个检测单元的荧光值并进行归一化处理; 4对各联合序列采用特征提取模型进行关键特征提取;具体为:将各联合序列输入至evo2深度学习模型,得到表征联合序列生物学特性的多维特征;对多维特征进行标准化和PCA降维;再采用Lasso回归对降维后的特征进行筛选得到关键特征; 5基于联合序列及其对应的归一化荧光值构建标签集;基于联合序列及其对应的关键特征构建训练集;构建集成模型并采用标签集和训练集进行训练;将特征提取模型与训练好的集成模型组成机器学习模型; 6对于新的靶标序列和PAM序列,将其结合为待分析的联合序列,再输入步骤5得到的机器学习模型,得到预测荧光值,基于预测荧光值判断Cas蛋白对联合序列的识别能力。
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