西安交通大学郭燕获国家专利权
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龙图腾网获悉西安交通大学申请的专利错配sgRNA选取方法及其在DNA特定位点上CRISPR系统中的应用获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN116798511B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-11-14发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202310397466.9,技术领域涉及:G16B20/20;该发明授权错配sgRNA选取方法及其在DNA特定位点上CRISPR系统中的应用是由郭燕;胡维欣;荣誉;董珊珊;杨铁林设计研发完成,并于2023-04-13向国家知识产权局提交的专利申请。
本错配sgRNA选取方法及其在DNA特定位点上CRISPR系统中的应用在说明书摘要公布了:本发明涉及一种错配sgRNA选取方法及其在DNA特定位点上CRISPR系统中的应用,涉及基因编辑领域,该方法包括:搭建sgRNA脱靶错配活性预测模型、给定DNA位点上错配sgRNA活性的预测与挑选、挑选出的错配sgRNA脱靶效应预测。本发明通过分析sgRNA‑DNA序列对在不同匹配情况下错配sgRNA活性的改变规律,建立基于深度学习模型的sgRNA错配活性预测模型,并对给定DNA位点上与之结合的错配sgRNA进行活性预测与脱靶效应分析。本发明将与目标DNA位点有错配关系的sgRNA列入备选,扩大了sgRNA设计的可能性,能够有效降低该位点上CRISPR系统的脱靶效应,适用于所有需要CRISPRCas9系统降低脱靶效应的情形,例如基因敲除、基因治疗等,可以解决现有sgRNA技术方法的局限性。
本发明授权错配sgRNA选取方法及其在DNA特定位点上CRISPR系统中的应用在权利要求书中公布了:1.一种错配sgRNA选取方法,其特征在于,包括如下步骤: P1,利用已公开的HEK293T中sgRNA-DNA相对活性数据集搭建sgRNA错配相对活性预测模型; P2,针对任意sgRNA靶向的DNA位点,生成与该DNA位点相结合的错配sgRNA集合和完全匹配sgRNA,并通过sgRNA错配活性预测模型,对错配sgRNA集合中的每个错配sgRNA,获得与完全匹配sgRNA比较的相对活性预测值; 错配sgRNA集合的生成过程包括以下步骤: P21,针对给定的DNA位点,生成与之序列一致的完全匹配sgRNA的序列; P22,选择完全匹配sgRNA序列上的n个位置,改变n个位置上的碱基的类型,形成m个组合,改变后的序列记为错配sgRNA,直至已穷尽与完全匹配sgRNA序列不同的所有的m个碱基组合; P3,从错配sgRNA集合中根据相对活性预测值选取候选错配sgRNA,并分别预测每个候选错配sgRNA的脱靶效应; P4,比较完全匹配sgRNA、P3中候选错配sgRNA的打靶活性与脱靶效应,选取出具有较高打靶活性且兼具较低脱靶效应的候选错配sgRNA,即为目标错配sgRNA。
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