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广西壮族自治区水牛研究所郑海英获国家专利权

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龙图腾网获悉广西壮族自治区水牛研究所申请的专利一种用于水牛的GBS全基因组关联分析方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN117095746B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-11-14发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202311086801.X,技术领域涉及:G16B20/20;该发明授权一种用于水牛的GBS全基因组关联分析方法是由郑海英;尚江华;杨春艳;郑威设计研发完成,并于2023-08-28向国家知识产权局提交的专利申请。

一种用于水牛的GBS全基因组关联分析方法在说明书摘要公布了:本发明公开了一种用于水牛的GBS全基因组关联分析方法,涉及基因组关联分析技术领域,其技术方案要点是:该方法包括测序数据质控、比对参考基因、SNP检测和注释、群体分层分析和全基因组关联分析几个步骤。利用该方法技术可以检测基因组上未知变异位点中新的SNP,SNP标记转化成功率高;一次测序获得数以百万计SNP位点,密度高;获取的每个SNP标记位点的成本比传统芯片技术降低一个数量级;该方法数据准确,技术稳定,操作简单,重复性高;利用高通量测序手段获得水牛SNP标记与性状关联分析,能够更全面、更精准的定位于目标性状相关的基因或分子模块,为水牛育种的分子选育和遗传改良提供更为精准的候选靶标。

本发明授权一种用于水牛的GBS全基因组关联分析方法在权利要求书中公布了:1.一种用于水牛的GBS全基因组关联分析方法,其特征是:所述全基因组关联分析方法包括以下步骤: S1.测序数据质控: 1过滤掉含有接头序列的水牛测序序列; 2当单端测序序列中未测出的碱基含量超过单端测序序列长度比例的10%时,需要去除此对碱基序列; 3当单端测序序列中含有的低质量碱基数超过单端测序序列长度比例的50%时,需要去除此对碱基序列; 4经过上述对水牛测序数据的严格过滤,得到高质量的有效数据; S2.比对参考基因:所述比对参考基因是将S1中得到的有效数据与参考基因组做比对,得到比对率、平均测序深度以及其他相关数据;群体样本平均比对率为95.25%~99.67%,对基因组的平均测序深度为7.33X~26.46X,1X覆盖度在2.26%以上,测序质量Q20≥93.60%、Q30≥85.00%; S3.SNP检测和注释: 1检测群体的SNP位点,并对获得的多态性位点过滤,过滤条件为dp2、Miss0.2、Maf0.01,得到高质量的SNP位点; 2对得到的高质量的SNP位点进行群体SNP注释; S4.群体分层分析:所述群体分层分析可采用群体进化树分析和群体主成分分析两种分析方法; S5.全基因组关联分析:所述全基因关联分析分为性状关联分析和目标性状相关区域基因功能注释两个步骤。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人广西壮族自治区水牛研究所,其通讯地址为:530001 广西壮族自治区南宁市邕武路24-1号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

以上内容由龙图腾AI智能生成。

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