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龙图腾网获悉苏州吉因加生物医学工程有限公司;深圳吉因加医学检验实验室;北京吉因加医学检验实验室有限公司申请的专利多癌种的甲基化标志物组合、筛选方法及其应用获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN118755832B 。

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-11-14发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202410881225.6，技术领域涉及：C12Q1/6886；该发明授权多癌种的甲基化标志物组合、筛选方法及其应用是由钟贤宇;刘青峰;李盼松;胡小曼;管彦芳;黄毅设计研发完成，并于2024-07-02向国家知识产权局提交的专利申请。

本多癌种的甲基化标志物组合、筛选方法及其应用在说明书摘要公布了：本公开提供了一种多癌种的甲基化标志物组合、筛选方法及其应用。所述甲基化标志物的筛选方法，以及由该方法获得的多癌种甲基化标志物及其应用，能够用于同时检测肝癌，肺癌，结直肠癌，胃癌，食管癌，胰腺癌，乳腺癌，卵巢癌等八种癌症，以及准溯源肿瘤发生部位的甲基化标志物组合；同时具体地提供了一种评估待测样本患癌风险和预测患者癌症信号的来源组织的方法或系统。本公开提供了一种高性能、简便、经济的、且能够同时对八种癌症进行早期筛查以及溯源的技术手段，有助进一步提高了患者的早期筛查率。

本发明授权多癌种的甲基化标志物组合、筛选方法及其应用在权利要求书中公布了：1.一种甲基化标志物的筛选方法，所述方法包括： S1获得癌种对应的癌组织样本和非癌的组织样本的甲基化测序结果，基于所述甲基化测序结果将基因组划分为多个甲基化区域； S2对所述癌种的癌组织样本和非癌的组织样本的甲基化区域进行差异化分析，筛选出相对于非癌的组织样本，所述癌种的平均甲基化率差异大于阈值分数的甲基化区域，合并去重后获得标志物集合A； 所述癌种的平均甲基化率差异大于阈值分数的甲基化区域包括筛选出甲基化率显著性高的甲基化区域； 所述步骤S2还包括对标志物集合A进行过滤的步骤；所述过滤的步骤包括：从标志物集合A中筛选出在非癌体液样本中平均甲基化率0.5以下的标志物集合A’； S3通过对所述癌种的癌组织样本与其他一种或多种癌种的癌组织样本的甲基化区域进行差异化分析，筛选出相对于其他一种或多种癌种的癌组织样本，所述癌种的平均甲基化率差异大于阈值分数的甲基化区域，合并去重后获得标志物集合B； 所述步骤S3还包括对标志物集合B进行过滤的步骤；所述过滤的步骤包括：从标志物集合B中筛选出在其他一种或多种癌种的组织样本中平均甲基化率0.5以下的标志物集合B’； S4对所述癌种的体液样本和非癌体液样本中的标志物集合A’进行靶向甲基化测序，获得各标志物在所述癌种中的覆盖度E1，基于覆盖度E1得到标志物集合C； 所述获得各标志物在所述癌种中的覆盖度E1包括：选择甲基化率0.5以上且覆盖3个以上CpG位点的读段作为极端高甲基化读段，一个标志物的极端高甲基化读段占该标志物的总读段的比例作为该标志物的极端高甲基化读段比，基于阈值分位数对获得的癌种体液样本的各标志物的极端高甲基化读段比进行二元化处理，以确定各标志物的覆盖度E1； 所述阈值分位数的确定包括：对非癌血液样本中的各标志物的极端高甲基化读段比进行统计，并以所述极端高甲基化读段比的90％～99％分位数作为各标志物的阈值分位数； 所述基于覆盖度E1得到标志物集合C包括：选择覆盖度排名前200和或覆盖度大于1％的标志物； S5对所述癌种的体液样本和其他一种或多种癌种的体液样本中的标志物集合B’进行靶向甲基化测序，获得各标志物在所述癌种中的覆盖度E2，基于覆盖度E2得到标志物集合D； 所述获得各标志物在所述癌种中的覆盖度E2包括：选择甲基化率0.5以上且覆盖3个以上CpG位点的读段作为极端高甲基化读段，一个标志物的极端高甲基化读段占该标志物的总读段的比例作为该标志物的极端高甲基化读段比，基于阈值分位数对获得的癌种体液样本的各标志物的极端高甲基化读段比进行二元化处理，以确定各标志物的覆盖度E2； 所述步骤S5中，所述阈值分位数的确定包括：对其他一种或多种癌种的体液样本中的各标志物的极端高甲基化读段比进行统计，并以所述极端高甲基化读段比的90％～99％分位数作为各标志物的阈值分位数； 所述步骤S5中，所述基于覆盖度E2得到标志物集合D包括：选择覆盖度排名前200和或覆盖度大于1％的标志物； 和S6将标志物集合C和标志物集合D进行合并去重后获得标志物集合； 所述方法还包括：使用所述癌种的体液样本和所述非癌体液样本，采用迭代算法从标志物集合A’中筛选出灵敏度甲基化标志物，补充到标志物集合C中， 所述采用迭代算法从标志物集合A’中筛选出灵敏度甲基化标志物包括： M1采用以下公式计算每次新增标志物i的互补性增益得分Qi： 其中权重系数W1为1，权重系数W2为-1，权重系数W3为-2，Nc为标志物集合A的癌种体液队列中阳性标志物占比低于阈值P1的癌种体液样本，Nh1为标志物集合A的非癌体液样本队列中阳性标志物占比高于阈值P2且低于阈值P3的非癌体液样本，Nh2为标志物集合A的非癌体液样本队列中阳性标志物占比高于阈值P3的非癌体液样本，Rin代表新增标志物i在n样本的极端高甲基化读段比，Ci代表新增标志物i的阈值分位数； 所述阳性标志物为极端高甲基化读段比高于所述阈值分位数的标志物； 阈值P1为癌症体液样本中阳性标志物占比的50％～70％分位数； 阈值P2为非癌体液样本中阳性标志物占比的85％～93％分位数； 阈值P3为非癌体液样本中阳性标志物占比的93％～96％分位数； M2基于互补性增益得分Qi，选择每轮迭代过程中得分最高的标志物作为新增灵敏度标志物；和 M3在迭代过程设定两个条件作为迭代终止条件：①Qi小于等于0时，停止新增标志物的迭代过程，②以非癌样本阳性标志物占比的90％～99％分位数为阈值，当新增标志物后高于该阈值的癌种体液样本数目小于新增标志物前高于该阈值的癌种体液样本数目时，停止迭代过程。

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