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龙图腾网获悉杭州碳硅智慧科技发展有限公司申请的专利一种口袋内分子生成模型的训练方法及装置获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN116206677B 。

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-11-18发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202310172955.4，技术领域涉及：G16B15/30；该发明授权一种口袋内分子生成模型的训练方法及装置是由张昊天;侯廷军;谢昌谕;曹东升;邓亚峰;施慧设计研发完成，并于2023-02-10向国家知识产权局提交的专利申请。

本一种口袋内分子生成模型的训练方法及装置在说明书摘要公布了：本申请提供了一种口袋内分子生成模型的训练方法及装置。所述方法包括：获取训练数据，所述训练数据包括：蛋白分子的蛋白口袋拓扑文件；将所述蛋白口袋拓扑文件输入至待训练口袋内分子生成模型，所述待训练口袋内分子生成模型包括：相互作用学习网络层和生成网络层；调用所述相互作用学习网络层对所述蛋白口袋拓扑文件中的口袋表面特征进行处理，得到所述蛋白分子的口袋表面对应的相互作用特征；调用所述生成网络层对所述相互作用特征和所述口袋表面特征进行处理，得到所述口袋表面对应的预测结构特征；基于所述预测结构特征，计算得到所述待训练口袋内分子生成模型的损失值；在所述损失值处于预设范围内的情况下，将训练后的待训练口袋内分子生成模型作为所述口袋内分子生成模型。本申请可以达到在指定需要进行药物设计的蛋白靶标结构生成对应的活性分子及其构象的目的。

本发明授权一种口袋内分子生成模型的训练方法及装置在权利要求书中公布了：1.一种口袋内分子生成模型的训练方法，其特征在于，所述方法包括： 获取训练数据，所述训练数据包括：蛋白分子的蛋白口袋拓扑文件； 将所述蛋白口袋拓扑文件输入至待训练口袋内分子生成模型，所述待训练口袋内分子生成模型包括：相互作用学习网络层和生成网络层； 调用所述相互作用学习网络层对所述蛋白口袋拓扑文件中的口袋表面特征进行处理，得到所述蛋白分子的口袋表面对应的相互作用特征；所述口袋表面特征包括：表面电荷特征、氢键势特征、疏水相互作用特征、高斯曲率特征、平均曲率特征和形状指数特征中的至少一种； 调用所述生成网络层对所述相互作用特征和所述口袋表面特征进行处理，得到所述口袋表面对应的预测结构特征； 基于所述预测结构特征，计算得到所述待训练口袋内分子生成模型的损失值； 在所述损失值处于预设范围内的情况下，将训练后的待训练口袋内分子生成模型作为所述口袋内分子生成模型； 所述相互作用学习网络层包括：第一GNN网络层和第二GNN网络层； 所述调用所述相互作用学习网络层对所述蛋白口袋拓扑文件中的口袋表面特征进行处理，得到所述蛋白分子的口袋表面对应的相互作用特征，包括： 调用所述第一GNN网络层对所述口袋表面特征进行处理，得到所述口袋表面对应的拓扑相互作用特征； 调用所述第二GNN网络层对所述口袋表面特征和所述拓扑相互作用特征进行处理，得到所述口袋表面对应的几何相互作用特征； 将所述拓扑相互作用特征和所述几何相互作用特征作为所述相互作用特征； 所述生成网络层包括：拓扑生成模块和几何生成模块， 所述调用所述生成网络层对所述相互作用特征和所述口袋表面特征进行处理，得到所述口袋表面对应的预测结构特征，包括： 调用所述拓扑生成模块对所述相互作用特征和所述口袋表面特征进行处理，得到所述口袋表面对应的预测拓扑结构特征； 调用所述几何生成模块对所述相互作用特征、所述口袋表面特征和所述预测拓扑结构特征进行处理，得到所述口袋表面对应的预测几何结构特征； 将所述预测拓扑结构特征和所述预测几何结构特征作为所述预测结构特征。

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