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龙图腾网获悉上海欧易生物医学科技有限公司申请的专利一种上游细胞-miRNA-下游细胞网络构建方法及系统获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN116403640B 。

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-11-18发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202310304174.6，技术领域涉及：G16B20/00；该发明授权一种上游细胞-miRNA-下游细胞网络构建方法及系统是由公光业;林博;殷昊;张志明;肖云平设计研发完成，并于2023-03-27向国家知识产权局提交的专利申请。

本一种上游细胞-miRNA-下游细胞网络构建方法及系统在说明书摘要公布了：本发明公开了一种上游细胞‑miRNA‑下游细胞网络构建方法。通过鉴定单细胞核转录组数据中primarymiRNA及其在mRNA细胞类群中的表达数据，可获得上游细胞和miRNA关系对；通过关联外泌体miRNA表达数据、单细胞mRNA表达数据，可获得miRNA和下游细胞类型genemRNA关系对；最后基于前两种方法结果和单细胞转录组细胞通讯数据，可构建完整上游细胞‑miRNA‑下游细胞功能互作调控网络，为鉴定特定miRNA的来源细胞类型以及下游调控细胞类型，明确不同细胞类型之间的互作与调控提供了数据支持。实现从实验到生物信息分析的同一组织外泌体miRNA测序分析及单细胞核测序分析的完整技术方案。本发明还公开了实现上述方法的系统及方法的应用。

本发明授权一种上游细胞-miRNA-下游细胞网络构建方法及系统在权利要求书中公布了：1.一种基于外泌体miRNA和单细胞核转录组联合的上游细胞-miRNA-下游细胞网络构建方法，其特征在于，所述方法包括如下步骤： 步骤一、基于单细胞核转录组，获得不同细胞类型primarymiRNA的表达数据； 步骤二、基于步骤一中获得的不同细胞类型primarymiRNA的表达数据，将每一细胞类型与其他所有细胞类型进行primarymiRNA差异表达分析，获得上游细胞类型-miRNA关系对； 步骤三、对预先获得的外泌体miRNA结果和单细胞核不同细胞类型mRNA表达数据进行相关性分析，获得负相关miRNA-mRNA关系对； 步骤三包括： 步骤3.1、将某一单细胞核mRNA样本中每一细胞类型下所有细胞的mRNA表达取平均值，作为该样本该细胞类型的mRNA表达值； 步骤3.2、对预先获得的已有外泌体miRNA测序表达数据和步骤3.1中获得的每一细胞类型mRNA表达数据分别进行相关性分析，获得外泌体miRNA-单细胞转录组mRNA关系对； 步骤3.3、按照默认相关性系数≤-0.8，P值小于0.05的阈值，对步骤3.2的外泌体miRNA-单细胞转录组mRNA关系对进行筛选，提取符合阈值的负相关miRNA-mRNA关系对； 步骤3.3还包括：基于miRWalk和miRDB数据库研究物种的miRNA-mRNA靶标关系，对步骤3.2的外泌体miRNA-单细胞转录组mRNA结果进行交集提取，获得符合靶标关系的负相关miRNA-mRNA关系对； 所述交集提取是指将数据库的miRNA-gene关系对与步骤3中获得的外泌体和单细胞的miRNA-gene关系对，对miRNA和对应gene一致的取同，获得筛选后的miRNA-gene关系对； 步骤四、基于mRNA单细胞的细胞通讯配体gene、受体gene和对应细胞类型数据，结合步骤三相关性分析获得的各细胞类型下miRNA-mRNA相关性关系对，以miRNA调控靶gene和细胞通讯中的配体或受体gene作为媒介，获得miRNA-下游细胞类型关系对； 步骤五、基于步骤四获得的miRNA-下游细胞类型关系对和步骤二获得的上游细胞类型-miRNA关系对，以miRNA为媒介，结合细胞通讯的配体细胞与受体细胞作用关系，整合获得包含细胞与细胞通讯关系的上游细胞-miRNA-下游细胞网络。

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