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上海算法创新研究院;北京深势科技有限公司温翰获国家专利权

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龙图腾网获悉上海算法创新研究院;北京深势科技有限公司申请的专利一种mRNA疫苗设计任务的处理方法和装置获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119479809B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-11-18发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202411478355.1,技术领域涉及:G16B30/00;该发明授权一种mRNA疫苗设计任务的处理方法和装置是由温翰;李永歌;顾睿初;王喜;龚禹桥;司端淼;张林峰设计研发完成,并于2024-10-22向国家知识产权局提交的专利申请。

一种mRNA疫苗设计任务的处理方法和装置在说明书摘要公布了:本发明实施例涉及一种mRNA疫苗设计任务的处理方法和装置,所述方法包括:以Uni‑RNA模型为主干设计一个用于对mRNA疫苗的三项特性进行预测的疫苗特性预测模型,并基于抗原疫苗数据集训练模型,并基于密码子使用频率、二级结构和GC含量这三项特征与疫苗稳定性、翻译效率和免疫原性间的最大关联关系设计三个目标函数;并根据用户输入的抗原序列进行mRNA序列初始化,并按NSGA‑II算法的多目标优化方式借助疫苗特性预测模型和三个目标函数以及对应的体外体内实验手段对mRNA序列集进行迭代优化处理得到对应的优化mRNA序列集向用户反馈。通过本发明可以提高序列丰富性、保证设计质量、提高设计效率、降低设计成本。

本发明授权一种mRNA疫苗设计任务的处理方法和装置在权利要求书中公布了:1.一种mRNA疫苗设计任务的处理方法,其特征在于,所述方法包括: 以Uni-RNA模型为特征提取主干设计一个用于对mRNA序列的三项疫苗特性进行预测的工作模型记为对应的疫苗特性预测模型;所述三项疫苗特性包括稳定性、翻译效率和免疫原性;所述疫苗特性预测模型包括所述Uni-RNA模型、三项基础特征预测头、特征融合模块和三项疫苗特性预测头; 通过大数据采集方式采集大量的抗原蛋白及其对应的mRNA疫苗信息构建对应的抗原疫苗数据集;并基于所述抗原疫苗数据集对所述疫苗特性预测模型进行模型训练;并在模型训练结束后对所述三项基础特征预测头的三项输出特征与所述三项疫苗特性预测头的三项输出特性之间的最大关联关系进行识别并基于识别结果确定对应的三个目标函数;所述三个目标函数包括稳定性目标函数、翻译效率目标函数和免疫原性目标函数; 接收用户输入的目标抗原蛋白的分子序列作为对应的第一抗原序列;并根据所述第一抗原序列进行mRNA序列初始化得到对应的第一mRNA序列集;并按NSGA-II算法的多目标优化方式,借助所述疫苗特性预测模型、所述三个目标函数以及对应的体外体内实验手段对所述第一mRNA序列集进行迭代优化处理得到对应的优化mRNA序列集向用户反馈;所述第一mRNA序列集由多个第一mRNA序列组成;所述优化mRNA序列集由一个或多个优化mRNA序列组成; 其中,所述疫苗特性预测模型用于对输入的mRNA序列的稳定性、翻译效率和免疫原性特征进行预测并输出对应的稳定性预测数据、翻译效率预测数据和免疫原性预测数据; 所述三项基础特征预测头包括密码子使用频率预测头、RNA二级结构预测头、GC含量预测头;所述三项疫苗特性预测头包括稳定性预测头、翻译效率预测头和免疫原性预测头; 所述Uni-RNA模型已经完成模型预训练;所述Uni-RNA模型用于对输入的所述mRNA序列进行特征编码处理得到对应的特征编码向量向所述密码子使用频率预测头、所述RNA二级结构预测头和所述GC含量预测头发送; 所述密码子使用频率预测头用于根据所述特征编码向量对所述mRNA序列上各碱基位置的密码子使用频率进行预测得到对应的密码子使用频率预测向量向所述特征融合模块发送; 所述RNA二级结构预测头用于根据所述特征编码向量对所述mRNA序列上各碱基位置的二级结构特征进行预测得到对应的二级结构预测向量向所述特征融合模块发送; 所述GC含量预测头用于根据所述特征编码向量对所述mRNA序列上各碱基位置的GC含量进行预测得到对应的GC含量预测向量向所述特征融合模块发送; 所述特征融合模块用于对所述密码子使用频率预测向量、所述二级结构预测向量和所述GC含量预测向量进行向量拼接得到对应的拼接向量向所述稳定性预测头、所述翻译效率预测头和所述免疫原性预测头发送; 所述稳定性预测头用于根据所述拼接向量对所述mRNA序列的稳定性特征进行预测并输出对应的所述稳定性预测数据; 所述翻译效率预测头用于根据所述拼接向量对所述mRNA序列的翻译特征进行预测并输出对应的所述翻译效率预测数据; 所述免疫原性预测头用于根据所述拼接向量对所述mRNA序列的免疫原性特征进行预测并输出对应的所述免疫原性预测数据。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人上海算法创新研究院;北京深势科技有限公司,其通讯地址为:201306 上海市浦东新区南汇新城镇环湖西一路333号城投大厦1号楼2楼219室、221室;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

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