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广州市金圻睿生物科技有限责任公司王杨获国家专利权

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龙图腾网获悉广州市金圻睿生物科技有限责任公司申请的专利一种基于贝叶斯模型的病原体鉴定方法及其应用获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN120148644B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-11-18发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202510230736.6,技术领域涉及:G16B40/00;该发明授权一种基于贝叶斯模型的病原体鉴定方法及其应用是由王杨;朱鹏远;吴春求;李元皓;陈嘉昌;柳俊;胡朝晖设计研发完成,并于2025-02-28向国家知识产权局提交的专利申请。

一种基于贝叶斯模型的病原体鉴定方法及其应用在说明书摘要公布了:本发明提供了一种基于贝叶斯模型的病原体鉴定方法及其应用,所述方法包括:收集病原体的DNA信息,从中筛选具有较高一致性的SNP位点,基于不同的病原体分型将SNP位点分成不同的cgSNPs组合;计算某一病原体分型的参考基因组在所有分型的参考基因组中的占比;计算各种病原体分型在各个cgSNPs组合类型中的比例分布情况;通过贝叶斯统计,在测序数据分析结果检出某一cgSNPs组合类型的状态下,对其检出的病原体分型的发生概率进行计算。

本发明授权一种基于贝叶斯模型的病原体鉴定方法及其应用在权利要求书中公布了:1.一种基于贝叶斯模型的病原体鉴定方法,其特征在于,所述方法包括: S1从数据库中收集病原体可用于近源病原体分型或病原体亚种分型的特定同源DNA序列,从中筛选具有较高一致性的SNP位点,基于不同的病原体分型将SNP位点分成不同的cgSNPs组合; S2计算某一病原体分型的参考基因组在所有分型的参考基因组中的占比,作为先验概率PA; S3将每种病原体分型对应的cgSNPs组合的数据整理成数据集,数据集中包括不同的cgSNPs组合类型,和不同的cgSNPs组合类型在不同病原体分型中的出现次数;统计数据集中各病原体分型在各cgSNPs组合类型中的比例分布情况,作为条件概率PB|A; S4基于PB|A和PA值,通过贝叶斯统计,在测序数据分析结果检出某一cgSNPs组合类型的状态下,对其检出的病原体分型的发生概率进行计算; ; 式中,PA为先验概率,B事件发生前对A事件的判断;PA|B为条件概率,即事件B发生后A的概率;PB为边缘概率,即在所有可能的A事件下,观察到B事件的概率;为可能性函数,调整使得预估概率更加接近真实概率; S1中,所述用于近源病原体分型或病原体亚种分型的特定同源DNA序列为在病原体所有分型或亚种分型中均携带的基因的集合; S1中,所述具有较高一致性的SNP位点的选择标准为:在某一菌种或亚种的多个菌株中稳定存在,且不存在于其他属、属内其他种或其他亚种的SNP位点; S2中,所述PA的计算公式为:PA=某一病原体分型的参考基因组统计次数所有分型的参考基因组统计次数; S3中,所述PB|A的计算公式为:PB|A=某一病原体分型中某一cgSNPs组合的统计次数某一病原体分型中所有的cgSNPs组合的统计次数; S4中,所述PB的计算公式如下所示: ; 式中,PB|A为病原体为A分型时cgSNPs组合的发生频率;PA为病原体为A分型时,在数据集的比例;PB|A'为病原体不为A分型时cgSNPs组合的发生频率;PA'为病原体为A分型以外时,在数据集的比例; 所述PA'的计算公式为:PA'=1-PA; 所述PB|A'为所有不为A分型的病原体观察到某一cgSNPs组合的概率之和; 所述PB|A'的计算方法为:某一不为A分型的病原体中某一cgSNPs组合的统计次数某一不为A分型的病原体中所有的cgSNPs组合的统计次数。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人广州市金圻睿生物科技有限责任公司,其通讯地址为:510000 广东省广州市黄埔区(国际生物岛)螺旋大道87号第十五层1501-1504、1513、1514单元;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

以上内容由龙图腾AI智能生成。

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