北京恩泽康泰生物科技有限公司时韦美获国家专利权
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龙图腾网获悉北京恩泽康泰生物科技有限公司申请的专利一种构建适用于转录组测序的血浆或血清外泌体RNA质量评估模型的方法及其应用获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN120375929B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-11-18发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202510547057.1,技术领域涉及:G16B30/10;该发明授权一种构建适用于转录组测序的血浆或血清外泌体RNA质量评估模型的方法及其应用是由时韦美;薛宁宁;李鸿艳;刘倩茹;赵敬;赵立波;刘翔设计研发完成,并于2025-04-28向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种构建适用于转录组测序的血浆或血清外泌体RNA质量评估模型的方法及其应用在说明书摘要公布了:本发明涉及一种构建适用于转录组测序的血浆或血清外泌体RNA质量评估模型的方法及其应用,通过筛选稳定表达的RNA候选因子,利用验证后的引物探针对外泌体RNA进行qPCR定量,获得Ct值;将外泌体RNACt值与RNA‑seq数据进行关联,筛选设定合理的Ct值作为参考阈值,对外泌体RNA质量进行等级划分,作为RNA‑seq数据合格与否的衡量指标,既可单独评估外泌体miRNA或mRNA质量,也可同时评估两种RNA质量。本发明可以及时有效评估上游样品采集、外泌体分离、RNA提取等方法是否恰当,并且可减少低质量样本流转至下游高通量文库构建实验环节,降低人力、样本、试剂耗材等成本损耗。
本发明授权一种构建适用于转录组测序的血浆或血清外泌体RNA质量评估模型的方法及其应用在权利要求书中公布了:1.一种构建适用于转录组测序的血浆或血清外泌体RNA质量评估模型的方法,其特征在于,所述构建适用于转录组测序的血浆或血清外泌体RNA质量评估模型的方法包括以下步骤: 1采集血浆或血清样本,提取外泌体RNA; 2筛选稳定表达的RNA候选因子,对所述RNA候选因子进行qPCR引物探针设计和验证,利用验证后的引物探针对外泌体RNA进行qPCR定量,获得Ct值; 3将外泌体RNACt值与转录组文库库检结果、测序数据质控结果进行关联,筛选设定合理的Ct值作为参考阈值,对外泌体RNA质量进行等级划分; 步骤2所述筛选稳定表达的RNA候选因子具体包括: 去除接头和低质量序列,定量每个样本的RNA,根据疾病的发展进程对样本分组,依据分组信息,统计所有鉴定到的RNA每百万转录本中的转录本数TPM,由分组信息和TPM值计算得到CV2值,取CV2值最低的10个RNA进一步筛选,获得RNA候选因子; 所述CV2值的计算方法包括: Ave为每组样本的TPM值的均值,SD为每组样本的TPM值的标准差,每组样本组内TPM值变异系数CV=SDAve,CVSum为各组样本的CV值总和; GPAve为所有样本TPM值的均值,GPSD为所有样本TPM值的标准差,所有样本TPM值变异系数GPCV=GPSDGPAve,CV2=CVSum×GPCV。
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