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龙图腾网获悉武汉工程大学;中国人民解放军海军工程大学申请的专利一种基于基因共表达网络的单细胞伪轨迹识别方法获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN119724357B 。

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-11-21发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202411787079.7，技术领域涉及：G16B40/00；该发明授权一种基于基因共表达网络的单细胞伪轨迹识别方法是由李圆媛;张涵;任涛;郑晓颖;崔玲霞设计研发完成，并于2024-12-06向国家知识产权局提交的专利申请。

本一种基于基因共表达网络的单细胞伪轨迹识别方法在说明书摘要公布了：本发明属于单细胞数据分析技术领域，具体涉及一种基于基因共表达网络的单细胞伪轨迹识别方法。包括：S1：构建行为基因名称、列为细胞名称的单细胞转录数据矩阵；S2：预处理单细胞转录数据矩阵，构建细胞表达矩阵，对细胞表达矩阵进行特征基因筛选，得到单细胞基因表达矩阵；S3：构建基因共表达网络；S4：结合单细胞基因表达矩阵和基因共表达网络，构建基因秩差异表达网络；S5：对基因秩差异表达网络进行集成聚类，使用相似性网络融合得到最终的聚类结果，确定起始聚类，为各聚类中的细胞分配伪时间，推断细胞伪轨迹。本发明可以识别细胞的分化轨迹，且与原始的基因表达矩阵相比，利用相对表达顺序可以得到更稳定的识别结果。

本发明授权一种基于基因共表达网络的单细胞伪轨迹识别方法在权利要求书中公布了：1.一种基于基因共表达网络的单细胞伪轨迹识别方法，其特征在于：包括： S1：构建行为基因名称、列为细胞名称的单细胞转录数据矩阵； S2：预处理单细胞转录数据矩阵，构建细胞表达矩阵，对细胞表达矩阵进行特征基因筛选，得到单细胞基因表达矩阵； S3：根据单细胞基因表达矩阵，构建基因共表达网络；S3包括： S3.1：基于Pearson相关系数计算表达单细胞基因表达矩阵的基因相关性，得到相关矩阵： ； 和分别表示单细胞基因表达矩阵中第y行和第z行基因在第k个细胞的表达量，分别表示单细胞基因表达矩阵中矩阵中第y行和第z行基因的所有细胞中的平均表达量，相关矩阵代表m个基因间的皮尔逊相关系数，数值范围为； S3.2：对相关矩阵进一步相关性检验，保留具有显著水平下的相关基因，使用相关矩阵绝对值大小作为相关矩阵相关强度属性的度量： ； 其中，B0是绝对值化后的相关矩阵； S3.3：使用WGCNA方法计算阈值b0，保留相关性大于阈值的基因对，进而构建如下的基因共表达网络B： ； 其中，表示为基因共表达网络B，分别为基因共表达网络B的节点集和连边集，中包含元素，若第i个基因和第j个基因的相关性bij超过阈值b0，则，表示基因共表达网络B中两个基因存在直接关联，将第i个基因和第j个基因的相关性记做，表示第i个基因和第j个基因已记录至基因共表达网络B的节点集；若第i个基因和第j个基因的相关性不超过阈值b0，则，表示这两个基因不存在直接关联，不加入基因共表达网络B； S4：结合单细胞基因表达矩阵和基因共表达网络，构建基因秩差异表达网络； S5：对基因秩差异表达网络进行集成聚类，使用相似性网络融合得到最终的聚类结果，确定起始聚类，为各聚类中的细胞分配伪时间，推断细胞伪轨迹。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术，可联系本专利的申请人或专利权人武汉工程大学;中国人民解放军海军工程大学，其通讯地址为：430205 湖北省武汉市东湖新技术开发区光谷一路206号；或者联系龙图腾网官方客服，联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

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