云南大学康雁获国家专利权
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龙图腾网获悉云南大学申请的专利一种基于Node2vec的轻量预测PPI的方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119479833B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-11-28发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202411540336.7,技术领域涉及:G16B40/20;该发明授权一种基于Node2vec的轻量预测PPI的方法是由康雁;袁虎;张开文;郑东升;彭越;姚晟哲;凌永军;徐寿颢;李浩设计研发完成,并于2024-10-31向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种基于Node2vec的轻量预测PPI的方法在说明书摘要公布了:本发明公开了一种基于Node2vec的轻量预测PPI的方法,包括以下步骤:蛋白质初始表示模块:使用Node2vec从蛋白质相互作用网络G=V,E中无监督地学习蛋白质初始表示;多尺度关系结构表示模块:设置两种不同尺度的GNN,以捕获蛋白质相互作用网络中的浅层和深层结构信息,其中包括用于浅层结构信息的SGCN变体和用于深层结构信息的Mamba模块;对SGCN和Mamba学习获得的蛋白质特征表示进行加权和求和,得到最终的蛋白质表示;在预测模块中,将深度蛋白质表示和浅层蛋白质表示进行元素相乘,增强特征的语义信息,然后进行预测。通过引入无监督学习方法Node2vec进行无监督地学习蛋白质的初始表示,然后采用图神经+注意力的有监督的进行精细学习,统筹蛋白质初始表示中的局部特征和全局特征。
本发明授权一种基于Node2vec的轻量预测PPI的方法在权利要求书中公布了:1.一种基于Node2vec的轻量预测PPI的方法,其特征在于,包括以下步骤: 蛋白质初始表示模块:使用Node2vec从蛋白质相互作用网络中无监督地学习蛋白质初始表示; 多尺度关系结构表示模块:设置两种不同尺度的GNN,以捕获蛋白质相互作用网络中的浅层和深层结构信息,其中包括用于浅层结构信息的SGCN变体和用于深层结构信息的Mamba模块; 对SGCN和Mamba学习获得的蛋白质特征表示进行加权和求和,得到最终的蛋白质表示; 在预测模块中,将深度蛋白质表示和浅层蛋白质表示进行元素相乘,在保留详细信息的同时增强特征的语义信息,然后进行预测。
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