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西藏自治区农牧科学院水产科学研究所;吉林农业大学肖世俊获国家专利权

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龙图腾网获悉西藏自治区农牧科学院水产科学研究所;吉林农业大学申请的专利基于测序数据分析染色体核型的方法、装置及存储介质获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119811474B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-11-28发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202411980032.2,技术领域涉及:G16B20/00;该发明授权基于测序数据分析染色体核型的方法、装置及存储介质是由肖世俊;刘飞;彭美设计研发完成,并于2024-12-31向国家知识产权局提交的专利申请。

基于测序数据分析染色体核型的方法、装置及存储介质在说明书摘要公布了:本发明公开了一种基于测序数据分析染色体核型的方法、装置及存储介质,涉及生物信息学技术领域。其中,该方法包括:对高通量测序获得的测序数据进行质控和纠错,得到待分析基因序列数据;对待分析基因序列数据进行端粒查询和筛选,筛选出带端粒序列;对带端粒序列进行位置过滤、固定端对齐、端粒序列裁剪和区间化取值,得到固定长度的基因片段;将固定长度的基因片段两两排列组合,并进行全局比对,获得全局比对结果;基于全局比对结果进行相似性评分,构建全局比对得分矩阵;对全局比对得分矩阵进行相似性聚类分析,识别出所对应的物种的染色体核型信息。通过本发明,可利用高通量测序数据分析物种染色体核型,不受研究物种的限制。

本发明授权基于测序数据分析染色体核型的方法、装置及存储介质在权利要求书中公布了:1.一种基于测序数据分析染色体核型的方法,其特征在于,包括: 对高通量测序获得的测序数据进行质控和纠错,得到待分析基因序列; 对所述待分析基因序列进行端粒查询和筛选,筛选出带端粒序列; 对所述带端粒序列进行位置过滤、固定端对齐、端粒序列裁剪和区间化取值,得到固定长度的基因片段; 基于真核生物端粒位于染色体末端的位置信息,遍历所述带端粒序列,检查每个序列的端粒坐标是否符合所述位置信息,过滤掉与所述位置信息不符合的序列; 将带端粒序列的头端作为固定端,尾端作为非固定端,其中,所述头端指5'端,所述尾端指3'端; 检查每个带端粒序列的端粒是否位于固定端,对于端粒位于非固定端的序列,进行反向互补操作,使端粒转置于固定端; 基于固定端对所有带端粒序列进行位置对齐,并裁剪删除位于固定端的端粒; 以端粒的终止位置为起始点,往后取目标长度的片段,得到固定长度的基因片段; 将所述固定长度的基因片段两两排列组合,并进行全局比对,获得全局比对结果; 基于所述全局比对结果进行相似性评分,根据所述相似性评分构建全局比对得分矩阵; 设计相似性评分规则,对于全局比对结果的每一个碱基,若两条基因片段同一坐标位置碱基类型相同,则得一分,若同一坐标位置碱基类型不同,则不得分,若同一坐标位置存在碱基空缺,则罚一分; 遍历全局比对结果的每一个碱基,采用所述相似性评分规则对每两条基因片段进行计分; 根据所有基因片段之间的得分构建得分矩阵,其中,矩阵的行数和列数相等,均等于固定长度的基因片段的数量,矩阵的每个元素代表了两条固定长度的基因片段之间的相似性评分,得分越高,表示两条基因片段在比对中的相似性越高; 对所述全局比对得分矩阵进行相似性聚类分析,基于聚类分析结果,识别出所述待分析基因序列所对应的物种的染色体核型信息。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人西藏自治区农牧科学院水产科学研究所;吉林农业大学,其通讯地址为:850000 西藏自治区拉萨市城关区金珠西路130号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

以上内容由龙图腾AI智能生成。

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