中国科学院微生物研究所王芳获国家专利权
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龙图腾网获悉中国科学院微生物研究所申请的专利一种真菌多基因联合分析方法、系统、设备及介质获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN120126559B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-11-28发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202510194871.X,技术领域涉及:G16B30/00;该发明授权一种真菌多基因联合分析方法、系统、设备及介质是由王芳;陈奇;赵鹏;蔡磊;孙彦设计研发完成,并于2025-02-21向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种真菌多基因联合分析方法、系统、设备及介质在说明书摘要公布了:本发明涉及生物信息学技术领域,公开一种真菌多基因联合分析方法、系统、设备及介质,本发明通过获取待鉴定真菌样本的目标序列数据,利用原始参考序列实时构建针对各个目标标记基因的精准的序列比对参考库,并进行准确的多样本多基因成对序列比对与近缘序列获取,最终构建多基因系统发育树,实现全面的物种鉴定,显著提高物种鉴定的准确性和效率。本发明支持多样本精准鉴定、无需提前预知样本科属范围,并且具有其他生物类群的可拓展性,能够实现快速、精准鉴定,使其可以更广泛地应用在有精准、快速鉴定需求的场景,如进出口病原菌检疫、食品病原菌监测、生物安全以及生物制品的生产过程等。
本发明授权一种真菌多基因联合分析方法、系统、设备及介质在权利要求书中公布了:1.一种真菌多基因联合分析方法,其特征在于,包括: 获取待鉴定真菌样本的目标序列数据,其中,待鉴定真菌样本的目标序列数据中至少包括两个目标标记基因的序列数据和基因ID信息; 将待鉴定真菌样本的目标序列数据与原始参考序列进行成对序列比对,得到针对各个目标标记基因的序列比对参考库; 根据待鉴定真菌样本的目标序列数据,利用原始参考序列和针对各个目标标记基因的序列比对参考库,进行多样本多基因成对序列比对与近缘序列获取,得到待鉴定真菌样本中所有目标标记基因的近缘序列并集; 根据待鉴定真菌样本的目标序列数据及其所有目标标记基因的近缘序列并集,分别进行多序列比对并修剪序列,并将相同凭证样本的不同基因序列串联,构建得到多基因系统发育树,实现对待鉴定真菌样本的物种鉴定; 其中,所述将待鉴定真菌样本的目标序列数据与原始参考序列进行成对序列比对,得到针对各个目标标记基因的序列比对参考库,包括: 获取原始参考序列及其凭证样本、参考序列基因ID信息,并对原始参考序列进行质控处理,得到质控后参考序列,并形成总参考序列库; 根据质控后参考序列及其凭证样本、参考序列基因ID信息,得到凭证样本基因矩阵表; 根据凭证样本基因矩阵表、总参考序列库和目标标记基因的基因ID信息,提取同时具备所有目标标记基因的质控后参考序列,形成针对各个目标标记基因的序列比对参考库; 以及,所述根据待鉴定真菌样本的目标序列数据,利用原始参考序列和针对各个目标标记基因的序列比对参考库,进行多样本多基因成对序列比对与近缘序列获取,得到待鉴定真菌样本中所有目标标记基因的近缘序列并集,包括: 根据待鉴定真菌样本的目标序列数据,利用针对各个目标标记基因的序列比对参考库,分别对各个目标标记基因进行序列比对,得到各个目标标记基因的近缘参考序列数据; 根据各个目标标记基因的近缘参考序列数据,得到所有目标标记基因的近缘参考序列的凭证样本ID并集; 根据所有目标标记基因的近缘参考序列的凭证样本ID并集,利用总参考序列库,得到所有目标标记基因的近缘参考序列的凭证样本的参考序列,形成总近缘序列集,作为待鉴定真菌样本中所有标记基因的近缘序列并集。
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