厦门大学杨朝勇获国家专利权
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龙图腾网获悉厦门大学申请的专利基于图卷积神经网络的空间转录组数据注释方法及装置获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119864091B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-12-05发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202411933688.9,技术领域涉及:G16B40/20;该发明授权基于图卷积神经网络的空间转录组数据注释方法及装置是由杨朝勇;刘沛;宋佳设计研发完成,并于2024-12-26向国家知识产权局提交的专利申请。
本基于图卷积神经网络的空间转录组数据注释方法及装置在说明书摘要公布了:本发明公开了一种基于图卷积神经网络的空间转录组数据注释方法及装置,包括:获取待注释的癌症交界区切片的空间转录组数据并进行标准化,提取标准化后的空间转录组数据中的高变基因作为特征表达矩阵;基于空间转录组切片的区域之间的位置信息和特征表达矩阵构建初始图结构;将H&E图像按照空间转录组切片的每个区域进行切割,得到对应的H&E图像块;将对应的H&E图像块输入到图像特征提取模块,提取得到对应的图像特征,将对应的图像特征整合到初始图结构中,得到最终图结构;将最终图结构输入到经训练的空间转录组数据注释模型,得到待注释的癌症交界区切片的空间转录组数据中每个区域的注释结果。本发明能够有效提高预测注释的准确率。
本发明授权基于图卷积神经网络的空间转录组数据注释方法及装置在权利要求书中公布了:1.一种基于图卷积神经网络的空间转录组数据注释方法,其特征在于,包括以下步骤: 获取待注释的癌症交界区切片的空间转录组数据并进行标准化,得到标准化后的空间转录组数据,提取标准化后的空间转录组数据中的高变基因作为特征表达矩阵,所述特征表达矩阵中的元素为空间转录组切片的其中一个区域的其中一个基因的表达量; 基于所述空间转录组切片的区域之间的位置信息和所述特征表达矩阵构建初始图结构;构建基于预训练的深度神经网络的图像特征提取模块,获取与所述待注释的癌症交界区切片的空间转录组数据相对应的Hamp;E图像并按照空间转录组切片的每个区域进行切割,得到空间转录组切片的每个区域对应的Hamp;E图像块;将所述空间转录组切片的每个区域对应的Hamp;E图像块输入到所述图像特征提取模块,提取得到空间转录组切片的每个区域对应的Hamp;E图像块对应的图像特征,将所述空间转录组切片的每个区域对应的Hamp;E图像块对应的图像特征整合到所述初始图结构中,得到最终图结构; 构建基于图卷积神经网络模型的空间转录组数据注释模型,对所述空间转录组数据注释模型进行泛域化训练,得到经训练的空间转录组数据注释模型; 将所述最终图结构输入到所述经训练的空间转录组数据注释模型,得到所述待注释的癌症交界区切片的空间转录组数据中每个区域的注释结果。
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