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南京工业大学;南京信息工程大学高南获国家专利权

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龙图腾网获悉南京工业大学;南京信息工程大学申请的专利一种用于鉴别近缘微生物的核苷酸片段的筛选方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN109266768B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-12-12发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:201811373222.2,技术领域涉及:C12Q1/689;该发明授权一种用于鉴别近缘微生物的核苷酸片段的筛选方法是由高南;周超伟;申卫收;应汉杰设计研发完成,并于2018-11-19向国家知识产权局提交的专利申请。

一种用于鉴别近缘微生物的核苷酸片段的筛选方法在说明书摘要公布了:本发明公开了一种用于鉴别近缘微生物的核苷酸片段的筛选方法,该方法是将目标微生物的全基因序列利用电子剪切技术剪切成含重叠区的核酸小片段;核酸小片段的fasta文件在NCBINT数据库中比对;得到命中表Ⅰ,删除重复序列,进而获得命中核酸序列;命中核酸序列Ⅰ与含重叠区的核酸小片段进行比对,获得非命中核酸序列;重复上述步骤一次,设计PCR引物,提取目标微生物菌株所在属或近缘属的菌株10种以上的基因组总DNA,构建核酸池,PCR扩增验证。本发明提供的用于近缘菌株鉴别的特异性核酸筛选方法能够高效率地大量获得目的微生物菌株的特异性核酸序列,实验结果的可重现性极高,简化了整个实验过程,具有良好的适用性。

本发明授权一种用于鉴别近缘微生物的核苷酸片段的筛选方法在权利要求书中公布了:1.一种用于鉴别近缘微生物的核苷酸片段的筛选方法,其特征在于,该方法包括如下步骤: 1获得目标微生物的全基因序列; 2利用splitter在线软件的电子剪切技术,将目的菌株的基因组序列剪切成含重叠区的核酸小片段;所述含重叠区的核酸小片段,其重叠区的长度为100~500bp,所述核酸小片段的长度为200~1500bp; 3将步骤2得到含重叠区的核酸小片段的fasta文件在NCBINT数据库中比对;比对时,选择目标微生物菌株对应的属,其他参数均设为默认值; 4步骤3比对后得到命中表Ⅰ,删除命中表Ⅰ中的重复序列,进而获得命中核酸序列Ⅰ; 5将步骤4得到的命中核酸序列Ⅰ与步骤2得到的含重叠区的核酸小片段进行比对,获得非命中核酸序列Ⅰ; 6将步骤5中获得的非命中核酸序列Ⅰ在NCBINT数据库中再次进行比对,获得命中表Ⅱ,删除命中表Ⅱ中的重复序列,进而获得命中核酸序列Ⅱ; 7重复步骤5,将步骤6获得的命中核酸序列Ⅱ与步骤2得到的含重叠区的核酸小片段进行比对,获得非命中核酸序列Ⅱ,该非命中核酸序Ⅱ列即为可能的目标微生物的菌株特异性核酸片段; 8以步骤7获得的可能的目标微生物的菌株特异性核酸片段为模板,设计PCR引物; 9提取目标微生物菌株所在属或近缘属的菌株10种以上的基因组总DNA,构建核酸池; 10分别以目标微生物菌株的基因组DNA和步骤9获得的核酸池为模板,利用步骤8设计的引物进行PCR扩增,扩增产物进行琼脂糖电泳检测; 若以目标微生物菌株的基因组DNA为模板的PCR检测为阳性,且以步骤9获得的核酸池为模板的PCR检测为阴性的引物对应的核酸片段,即为用于目标微生物菌株鉴别的特异性核酸片段。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人南京工业大学;南京信息工程大学,其通讯地址为:210009 江苏省南京市新模范马路5号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

以上内容由龙图腾AI智能生成。

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