中国科学院生态环境研究中心刘娴获国家专利权
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龙图腾网获悉中国科学院生态环境研究中心申请的专利化学品潜在生物靶点预测模型的建立方法、预测方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN116612821B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-12-19发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202310484219.2,技术领域涉及:G16B40/00;该发明授权化学品潜在生物靶点预测模型的建立方法、预测方法是由刘娴;易航;张爱茜;薛峤;潘文筱设计研发完成,并于2023-04-28向国家知识产权局提交的专利申请。
本化学品潜在生物靶点预测模型的建立方法、预测方法在说明书摘要公布了:一种化学品潜在生物靶点预测模型的建立方法、预测方法,该建立方法包括:获取蛋白质相互作用网络及化学品影响下包含差异化基因的转录组数据;将差异化基因的差异化分数沿蛋白‑蛋白相互作用网络扩散至临近基因节点,得到扩散后的差异化基因节点;分别计算每个基因节点与扩散后的差异化基因节点之间的平均最短距离;基于平均最短距离对蛋白质相互作用网络中基因节点进行排序,得到靶点蛋白预测列表;对扩散的参数进行调整直至靶点蛋白预测列表满足第一预测准确度条件;选择满足第一预测准确度条件的靶点蛋白预测列表的截断值,以使在截断值之前的靶点蛋白预测列表满足第二预测准确度条件。本发明利用该预测模型可快速、准确地预测潜在生物靶点。
本发明授权化学品潜在生物靶点预测模型的建立方法、预测方法在权利要求书中公布了:1.一种化学品潜在生物靶点预测模型的建立方法,包括以下步骤: 获取蛋白质相互作用网络,以及化学品影响下包含差异化基因的转录组数据,其中所述蛋白质相互作用网络中的每个蛋白质节点对应一个基因节点; 将所述差异化基因的差异化分数沿所述蛋白质相互作用网络扩散至所述差异化基因的临近基因节点,得到扩散后的差异化基因节点; 分别计算所述蛋白质相互作用网络中对应的每个基因节点与所述扩散后的差异化基因节点之间的平均最短距离; 按照所述平均最短距离由小到大的排序方式对所述蛋白质相互作用网络对应的所有基因节点进行排序,得到与排序后基因节点相对应的靶点蛋白预测列表; 对所述扩散的参数进行调整,并重复所述扩散、所述计算和所述排序的操作,直至所述靶点蛋白预测列表相对于所述化学品的真实生物靶点数据满足第一预测准确度条件; 选择满足所述第一预测准确度条件的所述靶点蛋白预测列表的截断值,以使在所述截断值之前的靶点蛋白预测列表相对于所述化学品的真实生物靶点数据满足第二预测准确度条件,完成所述化学品潜在生物靶点预测模型的建立。
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