买专利卖专利找龙图腾，真高效！ 查专利查商标用IPTOP,全免费！专利年费监控用IP管家,真方便！

龙图腾网获悉华中科技大学申请的专利一种基于二代和三代测序技术的宏病毒组分析方法获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN115691679B 。

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-12-23发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202211393634.9，技术领域涉及：G16B40/30；该发明授权一种基于二代和三代测序技术的宏病毒组分析方法是由陈卫华;孙楚晴;高娜设计研发完成，并于2022-11-08向国家知识产权局提交的专利申请。

本一种基于二代和三代测序技术的宏病毒组分析方法在说明书摘要公布了：本发明公开了一种基于二代和三代测序技术的宏病毒组分析方法，包括对二代测序原始数据进行质量控制和过滤，得到cleanreads，对质控后的数据进行单样本和多样本组装得到contigs序列；对三代测序原始数据进行校正和质量控制，得到clean长序列，对质控后的三代数据进行组装得到contigs序列；对二三代测序的质控后数据进行混合组装得到contigs序列；将所有contig合并构建非冗余的contigs集合；最后进行病毒的识别和判定、病毒的物种注释和功能注释。本发明提出了可靠的基于二代和三代测序技术的宏病毒组的分析方法，其实现方法简单，应用范围广泛。

本发明授权一种基于二代和三代测序技术的宏病毒组分析方法在权利要求书中公布了：1.一种基于二代和三代测序技术的宏病毒组分析方法，其特征在于，包括以下步骤： 1将二代基因组测序所得的原始高通量测序数据进行过滤，得到过滤后的数据；将该过滤后的数据进行组装，得到二代组装contigs； 2将三代基因组测序所得的原始高通量测序数据进行过滤，得到过滤后的数据；将该过滤后的数据进行组装，得到三代组装contigs；该步骤中的组装根据样本测序数据量的大小进行，单样本测序数据量超过100G时，使用以下方法1或方法2的单一组装方法；若小于等于100G，则同时使用以下两种组装方法；其中： 方法1：通过reads长度、测序深度和基因组大小运用deBruijn算法计算出性能最佳的K-mer，将其作为固定K-mer值检测重复序列并组装成contigs序列； 方法2：采用少数服从多数原则对reads进行纠错修正，根据重叠度确定碱基一致的区域为高质量区域，修整不能完全重叠的低质量区域；重新计算重叠区的序列一致性，序列完全重叠区域为unitigs，重叠区域包含部分重叠的片段为contigs；然后对unitigs序列文件使用k-medoids聚类算法进行迭代binning，得到bins；再进行序列判定：即当contig的所有unitigs都属于同一bin，那么保留该contig，反之，则保留所有unitigs； 3二代和三代宏病毒组测序数据进行混合组装：同时采用以下两种组装方法，得到二代和三代混合组装的contigs；其中： 方法1：构建步骤1中过滤后的数据的拼接集，得到二代拼接集，利用贝叶斯模型方法将步骤2中过滤后的数据来填补二代拼接集中间不能相连的片段，得到contigs； 方法2：使用HYBRIDSPADES算法对步骤1中过滤后的数据和步骤2中过滤后的数据进行组装得到contigs； 4构建非冗余的contigs集合：将步骤1得到的二代组装contigs、步骤2得到的三代组装contigs以及步骤3得到的二代和三代混合组装的contigs合并，根据序列的相似度将大于95％的序列聚类成一个cluster，选取最长的序列作为该cluster的代表序列，所有的代表序列即为获得的非冗余contigs集合； 5病毒序列的识别和判定：对步骤4中得到的非冗余的congtigs集合采用不少于三种方法进行病毒识别和判定，至少被两种方法识别为病毒的contigs被保留；将保留的contigs与病毒组数据库进行比对来判定完整性，过滤掉大于10％的错误匹配，最终保留的contigs被判定为病毒序列；病毒识别的方法包括： 方法1：应用机器学习使用基因组特征进行病毒识别；所述基因组特征包括结构、功能、分类注释和病毒标志基因； 方法2：基于病毒序列K-mers词频和机器学习识别病毒序列； 方法3：基于深度学习算法，设计出双通道卷积神经网络的网络结构，有效地对DNA片段进行病毒识别。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术，可联系本专利的申请人或专利权人华中科技大学，其通讯地址为：430074 湖北省武汉市洪山区珞喻路1037号；或者联系龙图腾网官方客服，联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

以上内容由龙图腾AI智能生成。