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龙图腾网获悉上海天壤智能科技有限公司申请的专利蛋白质三维结构预测方法及系统获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN116453584B 。

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-12-23发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202310431274.5，技术领域涉及：G16B15/20；该发明授权蛋白质三维结构预测方法及系统是由苗洪江;汤一珂;曹嵩;薛贵荣设计研发完成，并于2023-04-20向国家知识产权局提交的专利申请。

本蛋白质三维结构预测方法及系统在说明书摘要公布了：本发明提供了一种蛋白质三维结构预测方法及系统，包括：步骤S1：获取蕴含蛋白质共进化信息的多序列排列矩阵以及蛋白质模板，并进行MSA序列与残基对编码的转换，获得MSA序列编码与残基对编码；步骤S2：MSA序列编码与残基对编码通过循环注意力神经网络进行更新生成最新MSA序列编码与残基对编码；步骤S3：基于当前残基对编码、目标序列编码以及起始主链框架Ti通过不变点注意力神经网络对当前的目标序列编码进行更新；步骤S4：基于当前目标序列编码更新主链框架，并计算氨基酸间的扭转角度，从而得到蛋白质主链结构，再通过残基网络计算出侧链原子角度与最终三维结构。

本发明授权蛋白质三维结构预测方法及系统在权利要求书中公布了：1.一种蛋白质三维结构预测方法，其特征在于，包括： 步骤S1：获取蕴含蛋白质共进化信息的多序列排列矩阵以及蛋白质模板，并进行MSA序列与残基对编码的转换，获得MSA序列编码与残基对编码； 步骤S2：MSA序列编码与残基对编码通过循环注意力神经网络进行交叉迭代更新生成最新MSA序列编码与残基对编码； 步骤S3：当前残基对编码以及目标序列编码通过不变点注意力神经网络对当前的目标序列编码进行更新； 步骤S4：基于当前目标序列编码中蕴藏的残基对间的相互作用信息更新主链框架，并计算残基间与原子间的扭转角度，从而预测蛋白结构； 所述蕴含蛋白质共进化信息的多序列排列矩阵是基于包括突变、插入、删除、重组的进化事件的前提下，把多个氨基酸序列中相对应残基对齐并逐列进行比较，从而构建与被预测蛋白质序列相似的数据集； 所述蛋白质模板是基于蛋白质结构数据库中与目标蛋白质相似的已知结构蛋白质； 所述循环注意力神经网络是利用多头神经网络对序列边和残基边分别并互相优化更新，同时利用三角更新机制对残基对编码进行更新； 所述步骤S3中的不变点注意力神经网络采用：目标序列编码经由线性层分别计算每个氨基酸对应的编码空间与3D空间的query、key和value向量，再根据注意力机制计算出编码空间的注意力矩阵与基于起始主链框架全局不变换的3D空间的注意力矩阵，并将当前残基对编码作为注意力矩阵的偏差值引入，得到最终注意力矩阵，通过注意力矩阵迭代更新目标序列编码。

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