上海序祯达生物科技有限公司费家俊获国家专利权
买专利卖专利找龙图腾,真高效! 查专利查商标用IPTOP,全免费!专利年费监控用IP管家,真方便!
龙图腾网获悉上海序祯达生物科技有限公司申请的专利从NGS产生的未确定FastQ文件中生成目标FastQ文件的方法和系统获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN116701326B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-12-23发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202210177362.2,技术领域涉及:G06F16/174;该发明授权从NGS产生的未确定FastQ文件中生成目标FastQ文件的方法和系统是由费家俊;唐英荣;田常丰;洪强;李萌;马臻;龚崝设计研发完成,并于2022-02-24向国家知识产权局提交的专利申请。
本从NGS产生的未确定FastQ文件中生成目标FastQ文件的方法和系统在说明书摘要公布了:本发明提供一种从NGS产生的未确定FastQ文件中生成目标FastQ文件的方法和系统,以及一种计算机可读存储介质和终端。该方法包括以下步骤:S1、准备原始文件和Index信息得到所述NGS产生的未确定FastQ文件;S2、生成并修正分割点;S3、解压、过滤、压缩;S4、合并。该系统包括数据库单元,用于存储NGS产生的原始数据、样本信息、分析后产生的数据;处理单元,包括生成并修正分割点模块、解压过滤压缩模块、合并模块;所述数据库单元与所述处理单元通信。本发明能够较快且准确地从NGS产生的未确定FastQ文件中过滤到与客户提供的barcode匹配的FastQ文件,非常具有实用价值。
本发明授权从NGS产生的未确定FastQ文件中生成目标FastQ文件的方法和系统在权利要求书中公布了:1.一种从NGS产生的未确定FastQ文件中生成目标FastQ文件的方法,其特征在于,包括以下步骤: S1、准备原始文件和Index信息得到所述NGS产生的未确定FastQ文件; S2、生成并修正分割点:按照文件大小R将所述NGS产生的未确定FastQ文件切割成若干FastQ片段;对于切割得到的每个所述FastQ片段的边界点,需要在±M范围内进行bgzf的边界搜索;并使用搜索后的偏移量作为实际分割点对所述FastQ片段进行分割,得到分割后的FastQ片段;R为1-20Gb,M为32-128Kb; S3、解压、过滤、压缩:解压所述步骤S2分割后的FastQ片段,用目标barcodes过滤,然后再压缩得到经过过滤的FastQ片段; S4、合并:将所述步骤S3得到的经过过滤的FastQ片段按照顺序重新合并,生成所述目标FastQ文件; 所述步骤S4还包括伴随所述目标FastQ文件生成的还有md5校验,用于验证所述目标FastQ文件的真实性; 所述未确定FastQ文件是在NGS一级拆分结果中barcode与样本清单中barcode无法匹配的测序结果;所述目标FastQ文件是与客户提供的目标barcodes匹配的FastQ文件。
如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人上海序祯达生物科技有限公司,其通讯地址为:200120 上海市浦东新区中国(上海)自由贸易试验区奥纳路55号1幢607室;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。
以上内容由龙图腾AI智能生成。
1、本报告根据公开、合法渠道获得相关数据和信息,力求客观、公正,但并不保证数据的最终完整性和准确性。
2、报告中的分析和结论仅反映本公司于发布本报告当日的职业理解,仅供参考使用,不能作为本公司承担任何法律责任的依据或者凭证。

皖公网安备 34010402703815号
请提出您的宝贵建议,有机会获取IP积分或其他奖励