中南大学邓磊获国家专利权
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龙图腾网获悉中南大学申请的专利一种lncRNA和药物敏感性联系推断方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN117219174B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-12-23发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202310669976.7,技术领域涉及:G16B40/20;该发明授权一种lncRNA和药物敏感性联系推断方法是由邓磊;刘大运;李向辉设计研发完成,并于2023-06-07向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种lncRNA和药物敏感性联系推断方法在说明书摘要公布了:本公开实施例中提供了一种lncRNA和药物敏感性联系推断方法,属于生物信息学技术领域,具体包括:根据关联矩阵建立lncRNA和药物的二部图;根据定义的高阶可达规则,分别建立lncRNA超图和药物超图;进行超图卷积获取lncRNA更新嵌入表示和药物更新嵌入表示,并利用联合更新机制对超图卷积后的lncRNA嵌入表示和药物嵌入表示进行更新;在二部图上进行多层图卷积操作,并将更新后的lncRNA超图和药物超图的嵌入表示和二部图上的嵌入表示进行对比学习;使用内积预测出每个lncRNA和其对应药物的关联分数,并据此形成药物敏感性联系预测结果。通过本公开的方案,提高了推断效率和精准度。
本发明授权一种lncRNA和药物敏感性联系推断方法在权利要求书中公布了:1.一种lncRNA和药物敏感性联系推断方法,其特征在于,包括: 步骤1,根据lncRNA和药物敏感性关联矩阵建立lncRNA和药物的二部图; 所述步骤1具体包括: 根据已知的lncRNA和药物敏感性关联矩阵建立lncRNA和药物的二部图,lncRNA和药物的二部图表示为L,D,E,其中L和D为个lncRNA和个药物的集合,E为边的集合,对于每条边,e的一个顶点属于lncRNA集合,另一个顶点属于药物集合,代表这两个顶点所代表的lncRNA与药物已经有生物实验证明两者相关; 步骤2,根据定义的高阶可达规则,分别建立lncRNA超图和药物超图,并随机初始化lncRNA嵌入表示和药物嵌入表示; 所述步骤2具体包括: 步骤2.1,定义节点的lncRNA的k阶可达lncRNA; 步骤2.2,根据高阶连通性规则分别建立lncRNA超边组和药物超边组; 步骤2.3,将lncRNA超边组和药物超边组进行融合分别形成lncRNA超图和药物超图,其中,所述lncRNA超图的表达式为 ; 其中,表示超边组融合的函数,表示lncRNA的K阶可达邻居,表示lncRNA之间的K阶可达规则,表示lncRNA集合,表示lncRNA集合中的任一lncRNA; 所述药物超图的表达式为 ; 其中,表示药物的K阶可达邻居,表示药物之间的K阶可达规则,表示药物集合,表示药物集合中的任一药物; 步骤3,分别在lncRNA超图和药物超图上进行超图卷积获取lncRNA更新嵌入表示和药物更新嵌入表示,并利用联合更新机制对超图卷积后的lncRNA嵌入表示和药物嵌入表示进行更新; 所述步骤3具体包括: 步骤3.1,对超图关联矩阵和进行归一化; 步骤3.2,将初始化的lncRNA和药物的嵌入表示和超图关联矩阵将通过双通道输入超图卷积层,得到lncRNA更新嵌入表示和药物更新嵌入表示; 步骤3.3,利用联合更新机制对超图卷积后的lncRNA嵌入表示和药物嵌入表示进行更新; 步骤4,在二部图上进行多层图卷积操作获取lncRNA和药物在二部图上的嵌入表示,并将更新后的lncRNA超图和药物超图的嵌入表示和二部图上的嵌入表示进行对比学习; 步骤5,将学习后的二部图、lncRNA超图和药物超图的lncRNA和药物嵌入表示进行聚集得到lncRNA和药物最终的嵌入表示,并使用内积预测出每个lncRNA和其对应药物的关联分数,并据此形成药物敏感性联系预测结果。
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