Document
拖动滑块完成拼图
个人中心

预订订单
商城订单
发布专利 发布成果 人才入驻 发布商标 发布需求

请提出您的宝贵建议,有机会获取IP积分或其他奖励

投诉建议

在线咨询

联系我们

龙图腾公众号
首页 专利交易 IP管家助手 科技果 科技人才 积分商城 国际服务 商标交易 会员权益 需求市场 关于龙图腾
 /  免费注册
到顶部 到底部
清空 搜索
当前位置 : 首页 > 专利喜报 > 广西师范大学聂庆华获国家专利权

广西师范大学聂庆华获国家专利权

买专利卖专利找龙图腾,真高效! 查专利查商标用IPTOP,全免费!专利年费监控用IP管家,真方便!

龙图腾网获悉广西师范大学申请的专利一种识别癌症单驱动通路的CPGA-SMCMN方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN115359839B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-01-30发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202210987079.6,技术领域涉及:G16B20/50;该发明授权一种识别癌症单驱动通路的CPGA-SMCMN方法是由聂庆华;吴璟莉;李高仕设计研发完成,并于2022-08-17向国家知识产权局提交的专利申请。

一种识别癌症单驱动通路的CPGA-SMCMN方法在说明书摘要公布了:本发明公开了一种识别癌症单驱动通路的CPGA‑SMCMN方法,包括如下步骤:1、设定SMCMN模型;2、设定CPGA:2.1聚类;2.2染色体编码和初始种群;2.3适应值函数;2.4遗传算子;2.5CPGA具体流程。这种方法可以识别出更多生物信息,扩展性强,实用性强,能识别到更多富集在重要驱动通路上的基因。

本发明授权一种识别癌症单驱动通路的CPGA-SMCMN方法在权利要求书中公布了:1.一种识别癌症单驱动通路的CPGA-SMCMN方法,其特征在于,包括如下步骤: 1设定SMCMN模型: 假设有一个体细胞突变矩阵,一个拷贝数变异,体细胞突变矩阵和拷贝数变异的行代表同一组患者样本,列代表同一组基因,每个条目,表示第个基因是否在第个患者中发生突变,在矩阵,,表示第个基因在第个患者的统计显著变异区域中,否则;此外,和两个矩阵记录了基因之间的相关性,其中表示从String网络收录文献中记录的两个基因之间的关系,表示从String网络收录的相关基因实验获得的两个基因之间的相关性,和的范围从0到999; 二元变异矩阵由矩阵和构成,若和不同时等于0,则的值为1,,否则为0;一个新的相关矩阵也通过组合矩阵和生成,其中如下: 假设是的任意子矩阵,令,定义为矩阵覆盖的样本比例,即矩阵的“覆盖率”: , 其中表示矩阵所覆盖的样本集; 给定一对基因和,令代表和的相对汉明距离,即汉明距离基因相对于基因,公式: 其中 对于子矩阵,令表示基因和基因集之间的“互斥性”: 那么“互斥性”为衡量的每个基因与其余基因之间的平均越大,矩阵互斥性越高, , 给定子矩阵中包含的基因,让测量M矩阵中两个基因间的功能相关性,如下所示: , 其中表示矩阵的元素,它是从相关矩阵中提取的子矩阵; 基于上述定义,构造组合模型SMCMN,确定具有最大覆盖、互斥性和网络连通性的子矩阵:给定二元变异矩阵,相关矩阵,和一个参数,标识一个子矩阵最大化权重函数: ; 2设定CPGA: 设计一种基于基因簇和Partheno-GeneticAlgorithm,即CPGA来求解SMCMN模型,输入是一个二元变异矩阵、一个相关矩阵和一个参数,输出是子矩阵,以下描述CPGA关键步骤: 2.1聚类: 在预处理阶段为每个基因构建两个基因簇,给定基因,令记录与基因有汉明距离的基因集合,即,构造来记录与基因相关性的基因集合,即,和是两个预设参数; 2.2染色体编码和初始种群: 染色体,也称为个体,代表问题的解决方案,在CPGA中,使用一组个基因来编码一条染色体,即,生成初始染色体以生成初始种群,通过以下两个步骤创建初始染色体: 2.2.1用轮盘策略选择基因,即越大,则选择更多概率基因; 2.2.2用轮盘策略迭代选择剩余的个基因,假设,让,根据选择下一个基因,并且满足,是预设参数,若在任何一次迭代,则不能成功创建染色体; 2.3适应值函数: 适应度表示一个解决方案的好坏程度,在指导进化中起着至关重要的作用;令表示对应染色体的子矩阵,用于衡量染色体的适应度,被定义为如下等式,适应度越大,解决方案越好, , 2.4遗传算子: 在Partheno-Genetic中,仅应用选择算子和重组算子来生成后代,在CPGA中,采用轮盘赌选择,对适应度高的个体进行更大概率的挑选,精英策略也用于在进化过程中保持具有最高适应度的个体,设计了一个基于贪心的重组算子来生成新的后代,如下所示: 2.4.1给定一条染色体,随机执行以下两种方法之一,从中删除一个基因,1从中删除在最少患者中发生突变的基因,即,2从中随机删除一个基因,新的染色体用表示; 2.4.2令,在满足,是预设参数的前提下选择最大的基因,若从中没有找到符合条件的基因,则染色体保持不变; 2.5CPGA具体流程: 在CPGA中,设置了CPGA中使用的参数,CPGA中的第1步至第4步实现预处理,CPGA的第5步生成了一个大小为的初始种群,由和控制的整个进化过程从第6步执行到第19步,其中轮盘选择和重组算子从第9步到第13步迭代执行,最后,最佳个体在第20步和第21步中被转换和输出; 具体流程实现如下: 。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人广西师范大学,其通讯地址为:541004 广西壮族自治区桂林市七星区育才路15号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

以上内容由龙图腾AI智能生成。

免责声明
1、本报告根据公开、合法渠道获得相关数据和信息,力求客观、公正,但并不保证数据的最终完整性和准确性。
2、报告中的分析和结论仅反映本公司于发布本报告当日的职业理解,仅供参考使用,不能作为本公司承担任何法律责任的依据或者凭证。