上海金斯康生物科技有限公司;南京金斯瑞生物科技有限公司李根获国家专利权
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龙图腾网获悉上海金斯康生物科技有限公司;南京金斯瑞生物科技有限公司申请的专利预测突变对蛋白酶活性的影响获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119301685B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-01-30发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202480002536.9,技术领域涉及:G16B20/50;该发明授权预测突变对蛋白酶活性的影响是由李根;樊隆;张宁设计研发完成,并于2024-08-15向国家知识产权局提交的专利申请。
本预测突变对蛋白酶活性的影响在说明书摘要公布了:本公开涉及预测突变对蛋白酶活性的影响。在一种用于预测突变对蛋白酶活性影响的方法中,基于待预测蛋白酶样本序列信息,使用预训练模型进行特征提取,获得待预测蛋白酶样本的序列特征S110;基于待预测蛋白酶样本的三维结构信息,获得待预测蛋白酶样本的结构特征S120;基于序列特征和结构特征,使用基于图神经网络的预测模型进行预测,确定待预测蛋白酶样本突变后的活性变化预测结果S130。还公开了一种用于预测突变对蛋白酶活性影响的预测模型的构建方法。本公开的方法基于先进的自然语言处理模型和图神经网络,结合序列和三维结构,通过人工智能模型进行预测,表现出优于其他现有方法的性能,证明了其在蛋白酶工程中的广阔的应用前景。
本发明授权预测突变对蛋白酶活性的影响在权利要求书中公布了:1.一种用于预测突变对蛋白酶活性影响的方法,其特征在于,所述方法包括: 基于待预测蛋白酶样本在突变前的氨基酸序列信息和在突变后的氨基酸序列信息,分别使用预训练模型进行特征提取,获得所述待预测蛋白酶样本突变前的序列特征信息和突变后的序列特征信息; 将所述突变前的序列特征信息和所述突变后的序列特征信息进行拼接,得到所述待预测蛋白酶样本的序列特征; 基于待预测蛋白酶样本的三维结构信息,获得所述待预测蛋白酶样本的结构特征,包括:获取待预测蛋白酶样本的三维结构的坐标;根据获取的三维结构的坐标计算蛋白酶三维结构中氨基酸残基对之间的距离;当两个残基对之间的阿尔法碳原子距离小于10埃时,表示节点之间存在边的关系,记为1,否则为0,自身记为0,得到整个待预测蛋白酶样本的邻接矩阵;以突变位点为中心,从所述整个待预测蛋白酶样本的邻接矩阵中截取指定大小的邻接矩阵,作为所述待预测蛋白酶样本的结构特征; 基于所述序列特征和所述结构特征,使用基于图神经网络的预测模型进行预测,确定所述待预测蛋白酶样本突变后的活性变化预测结果。
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