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中国海洋大学三亚海洋研究院曾启繁获国家专利权

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龙图腾网获悉中国海洋大学三亚海洋研究院申请的专利一种基于混池简化基因组测序的全基因组选择育种方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN120989258B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-01-30发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202511509707.X,技术领域涉及:C12Q1/6888;该发明授权一种基于混池简化基因组测序的全基因组选择育种方法是由曾启繁;王师;林璐;唐凌雲;包振民;许圣钰;刘金礼设计研发完成,并于2025-10-22向国家知识产权局提交的专利申请。

一种基于混池简化基因组测序的全基因组选择育种方法在说明书摘要公布了:本发明提供一种基于混池简化基因组测序的全基因组选择育种方法,涉及育种领域。包括获取SNP位点的次等位基因比例和基因型数据,按照目标组大小分别进行混合,统计基因型混合后的每一种可能性结果所对应的等位基因频率的概率密度分布图,获得β分布的参数ɑ、β;将选育目标物种的基因型和表型数据按照目标组大小,分别进行混合后,通过拟合的β分布,抽样得到模拟真实混池测序的次等位基因比例,作为基因型,选择回归模型用于估计标记效应值,估算选育目标群体中每个个体的育种值。采用本发明方法,避免单个样本数据单一性的问题,同时可以五分之一甚至十分之一的参考群群体建立成本下,提高育种值预测准确度,更好进行南美白对虾、奶牛等育种。

本发明授权一种基于混池简化基因组测序的全基因组选择育种方法在权利要求书中公布了:1.一种基于混池简化基因组测序的全基因组选择育种方法,其特征在于,包括如下步骤: 步骤1,获取SNP位点的次等位基因比例和基因型数据;等位基因是二等位基因;对于基因型数据,如果在某个位点,SNP为两个主等位基因碱基类型,其位点基因型为0,SNP为两个次等位基因碱基类型,其位点基因型为2,否则为1; 步骤2,将次等位基因比例和基因型数据按照目标组大小,分别进行混合,统计基因型混合后的每一种可能性结果所对应的等位基因频率的概率密度分布图,获得β分布的参数ɑ、β; 步骤3,将选育目标物种的基因型和表型数据按照目标组大小,分别进行混合后,通过步骤2拟合的β分布,抽样得到模拟真实混池测序的次等位基因比例; 步骤4,将步骤3获得的次等位基因比例作为基因型,选择回归模型用于估计标记效应值; 步骤5,利用所得标记效应值与预测群体的基因型值,估算选育目标群体中每个个体的育种值; 还包括采用个体多性状分组算法对参考群体进行分组,个体多性状分组算法如下: M是最大迭代次数; c t表示当前迭代次数; c t+1表示下一轮迭代; 是第t次选代的第h个中心; 表示下一轮迭代的第h个中心; 是第i个要聚类的点; N表示聚类点的个数; K表示聚类中心点的个数; h表示第n个聚类,是聚类的索引,其值的范围是1~K;; m表示需要聚类的点的数量; t表示迭代次数的index; i表示聚类点的index; subjectto表示约束条件声明符; min_size表示最小样本数; max_size表示最大样本数; forh=1toK表示分组遍历循环; return表示返回最终结果。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人中国海洋大学三亚海洋研究院,其通讯地址为:572024 海南省三亚市崖州区崖州湾科技城用友产业园十号楼;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

以上内容由龙图腾AI智能生成。

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