深圳大学王弈蔚获国家专利权
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龙图腾网获悉深圳大学申请的专利细菌古基因组分析方法、装置及设备获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN121034397B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-01-30发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202511536798.6,技术领域涉及:G16B20/00;该发明授权细菌古基因组分析方法、装置及设备是由王弈蔚;温柔设计研发完成,并于2025-10-27向国家知识产权局提交的专利申请。
本细菌古基因组分析方法、装置及设备在说明书摘要公布了:本申请涉及基因组进化分析技术领域,特别涉及一种细菌古基因组分析方法、装置及设备,其中,方法包括:根据细菌的菌株数据中菌株系统进化树确定待合成古基因的分支节点;从待合成古基因的分支节点间选取分支菌株进行比对并提取同源片段;对每个菌株的同源片段进行定位分析,根据定位分析结果从同源片段中获取直系同源片段,拼接直系同源片段得到细菌的古基因组骨架;获取分支节点对应分支菌株的外群菌株的外群基因序列,根据分支节点对应分支菌株的外群菌株的外群基因序列补充细菌的古基因组骨架。由此,解决了如何快速且准确地对大批量的菌群数据进行分析,以获得菌群在各个发育节点上的古基因组等问题。
本发明授权细菌古基因组分析方法、装置及设备在权利要求书中公布了:1.一种细菌古基因组分析方法,其特征在于,包括以下步骤: 根据细菌的菌株数据中菌株系统进化树确定待合成古基因的分支节点; 从所述待合成古基因的分支节点间选取分支菌株进行比对提取同源片段; 对每个菌株的所述同源片段进行定位分析,根据定位分析结果从所述同源片段中获取直系同源片段,拼接所述直系同源片段得到所述细菌的古基因组骨架; 获取所述分支节点对应分支菌株的外群菌株的外群基因序列,根据所述分支节点对应分支菌株的外群菌株的外群基因序列补充所述细菌的古基因组骨架; 所述根据所述分支节点对应分支菌株的外群菌株的外群基因序列补充所述细菌的古基因组骨架,包括: 获取古基因组骨架的骨架序列和分支节点对应分支菌株的原基因序列; 将所述原基因序列分别与所述骨架序列和所述外群基因序列进行对比; 将对比结果中可补充片段补充至所述细菌的古基因组骨架,其中,所述可补充片段为所述骨架序列与所述原基因序列对比中不存在的片段、且所述外群基因序列与所述原基因序列对比中存在的片段; 所述将所述原基因序列分别与所述骨架序列和所述外群基因序列进行对比,还包括: 基于所述原基因序列与所述骨架序列的对比,生成所述骨架序列的直系同源块文件,根据所述骨架序列的直系同源块文件识别所述原基因序列中间隙区域,将所述间隙区域作为骨架块; 基于所述原基因序列与所述外群基因序列的对比,生成所述外群基因序列的直系同源块文件,根据所述外群基因序列的直系同源块文件识别可补充片段,将所述可补充片段作为补充块; 根据所述骨架块和所述补充块生成对比结果。
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