山东大学柳军涛获国家专利权
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龙图腾网获悉山东大学申请的专利基于一致性矩阵评分的单细胞聚类方法及系统获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN116741267B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-02-13发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202310713091.2,技术领域涉及:G16B20/30;该发明授权基于一致性矩阵评分的单细胞聚类方法及系统是由柳军涛;余忆琳设计研发完成,并于2023-06-15向国家知识产权局提交的专利申请。
本基于一致性矩阵评分的单细胞聚类方法及系统在说明书摘要公布了:本发明属于单细胞聚类方法领域,提供了基于一致性矩阵评分的单细胞聚类方法及系统,基于基因表达数据进行组合降维后,得到多个一致性矩阵,对每个一致性矩阵进行聚类,得到对应的聚类结果;结合一致性矩阵和其对应的聚类结果,采用打分方法计算出每一个一致性矩阵的f‑value,最高f‑value分值对应的一致性矩阵为最优一致性矩阵;基于得到的最优一致性矩阵,构建细胞间的距离矩阵,并对细胞间的距离矩阵采用层次聚类得到最终的聚类结果。充分利用细胞的间接距离,提高了聚类效果。
本发明授权基于一致性矩阵评分的单细胞聚类方法及系统在权利要求书中公布了:1.基于一致性矩阵评分的单细胞聚类方法,其特征在于,包括如下步骤: 获取基因表达数据; 基于基因表达数据进行组合降维后,得到多个一致性矩阵,对每个一致性矩阵进行聚类,得到对应的聚类结果; 结合一致性矩阵和其对应的聚类结果,采用打分方法计算出每一个一致性矩阵的f‑value,最高f‑value分值对应的一致性矩阵为最优一致性矩阵;其中,所述结合一致性矩阵和其对应的聚类结果,采用打分方法计算出每一个一致性矩阵的f‑value,具体包括: 计算一致性矩阵中每一行的类间距离和类内距离;基于每一行的类间距离和类内距离得到对应的f‑value,将各行的f‑value整合到一起,得到该一致性矩阵的f‑value; 基于得到的最优一致性矩阵,构建细胞间的距离矩阵,并对细胞间的距离矩阵采用层次聚类得到最终的聚类结果;所述构建细胞间的距离矩阵,包括: 将最优一致性矩阵作为最初的细胞间的相关系数矩阵; 引入指数增大相关系数之间的差异性,从而构建邻接矩阵; 基于邻接矩阵得到各细胞的连通度和拓扑重叠矩阵,根据拓扑重叠矩阵得到细胞间的距离矩阵。
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