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复旦大学曹志伟获国家专利权

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龙图腾网获悉复旦大学申请的专利一种流感病毒未来突变的预测方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN117352053B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-02-13发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202210735837.5,技术领域涉及:G16B20/50;该发明授权一种流感病毒未来突变的预测方法是由曹志伟;裘天颐;毛甜甜设计研发完成,并于2022-06-27向国家知识产权局提交的专利申请。

一种流感病毒未来突变的预测方法在说明书摘要公布了:本发明涉及生物技术领域,具体涉及一种预测流感病毒突变的方法,进一步涉及一种流感病毒衣壳蛋白HA表面抗原区域的划定方法及在预测流感病毒突变中的作用。一种预测流感病毒突变的方法包含:免疫原性区域划分、预测模板选择、模拟突变以及筛选及排序。本发明提供了预测流感未来突变的可行性,并提出了一个实用的模型来解决这一难题。本发明可以有助于提前开发预防性的治疗药物,以更好地应对流感威胁。

本发明授权一种流感病毒未来突变的预测方法在权利要求书中公布了:1.一种流感病毒衣壳蛋白HA表面抗原区域的划定方法,其特征在于:所述的方法包含以下步骤: S101流感病毒数据集预处理: 收集公共数据库流感HA核酸序列集D,用多序列比对工具比对并截取HA核苷酸序列中对应于HA1区域的第Ps×3‑2位至Pe×3位,获得HA1核酸序列集S,根据HA1核酸序列集S翻译蛋白序列集P;其中,Ps为HA1蛋白参考序列的起始位置,Pe为HA1蛋白参考序列的终止位置; S102序列系统发育树构建: 基于时空转换原则构成代表序列集T,用以构建系统发育树获得父‑子节点序列集PT; 所述的时空转换原则为:时间为在每个流感季中,分别挑选Nm条核酸序列,空间为这Nm条核酸序列分别来自不同区域和或国家,所述的Nm取值范围为5~100; S103预测免疫原性区域划分: 根据公式MFi=MiA计算HA1蛋白序列集P中每个位点的突变频率,获得高频突变位点集F;式中,MFi代表HA1蛋白序列中第i位的突变频率;Mi代表位点i发生突变的序列条数;A代表HA1的总条数; 将包含所有高频突变位点的集合定义为高频突变位点集F,所述的高频突变位点是指MFi0.05的位点; 从文献及数据库中收集实验验证的潜在免疫原性位点,获得实验位点集A; 定义F∪A为HA1潜在免疫原性位点集I,在HA1三维空间蛋白结构上,计算位点集I中各位点间距离矩阵Ddist,所述的位点距离矩阵Ddist的计算公式为Ddist={dij|i,j∈I,dij∈{氨基酸i和氨基酸j的最小平均中心碳原子距离}}; 根据聚类公式Cluster={ci,cj|Dminci,cjNC,ci,cj∈Ddist,i,j∈I},其中,NC取值范围为4~10埃,在三维空间内,按距离将位点集I聚集为n个预测免疫原性区域C={C1,C2,⋯Cn},并且使得每个预测免疫原性区域内的氨基酸位点个数Ma符合5≤Ma≤18。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人复旦大学,其通讯地址为:200433 上海市杨浦区邯郸路220号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

以上内容由龙图腾AI智能生成。

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