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南开大学刘健获国家专利权

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龙图腾网获悉南开大学申请的专利一种肿瘤微环境中解耦耗竭性T细胞的系统获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN116364188B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-03-17发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202310330384.2,技术领域涉及:G16B40/00;该发明授权一种肿瘤微环境中解耦耗竭性T细胞的系统是由刘健;阮志涵;陈娇设计研发完成,并于2023-03-30向国家知识产权局提交的专利申请。

一种肿瘤微环境中解耦耗竭性T细胞的系统在说明书摘要公布了:本发明涉及生物信息学技术领域,公开了一种肿瘤微环境中解耦耗竭性T细胞的系统,包括:对单细胞数据和空间转录组数据分别进行预处理;通过对预处理后的单细胞数据进行两次聚类分群和标记基因的计算,提取出肿瘤浸润性T细胞数据、耗竭性T细胞数据;对预处理后的肿瘤组织空间转录组数据进行聚类分群,得到若干个空间域;利用解卷积方法,在若干个空间域中识别出肿瘤浸润性T细胞的空间域,并在肿瘤浸润性T细胞的空间域中识别出耗竭性T细胞的空间域,并得到耗竭性T细胞在肿瘤浸润性T细胞中所占的比例。能够定位耗竭性T细胞在肿瘤微环境中的空间定位,从而进一步分析在不同肿瘤微环境下的结构与功能。

本发明授权一种肿瘤微环境中解耦耗竭性T细胞的系统在权利要求书中公布了:1.一种肿瘤微环境中解耦耗竭性T细胞的系统,其特征是,包括: 数据获取模块,其被配置为:获取肿瘤组织的单细胞数据和空间转录组数据; 预处理模块,其被配置为:对单细胞数据和空间转录组数据分别进行预处理; 提取模块,其被配置为:通过对预处理后的单细胞数据进行两次聚类分群和标记基因的计算,在预处理后的单细胞数据中提取出肿瘤浸润性T细胞数据,并在肿瘤浸润性T细胞数据中提取出耗竭性T细胞数据; 空间域划分模块,其被配置为:对预处理后的肿瘤组织空间转录组数据进行聚类分群,得到若干个空间域; T细胞定位模块,其被配置为:利用解卷积方法,将单细胞数据和肿瘤浸润性T细胞数据作为参考,在若干个空间域中识别出肿瘤浸润性T细胞的空间域; T细胞富集分析模块,其被配置为:利用解卷积方法,将肿瘤浸润性T细胞数据和耗竭性T细胞数据作为参考,在肿瘤浸润性T细胞的空间域中识别出耗竭性T细胞的空间域,并得到耗竭性T细胞在肿瘤浸润性T细胞中所占的比例; 所述提取模块包括第一标记基因识别模块; 所述第一标记基因识别模块,其被配置为:对预处理后的单细胞数据进行聚类分群,得到若干个第一分群,并计算每个第一分群的标记基因; 所述第一标记基因识别模块包括过滤模块; 所述过滤模块,其被配置为:针对某个第一分群,计算每一个基因在该第一分群和其他第一分群中的百分比和对数表达情况,进行基因过滤,得到过滤后的基因; 所述第一标记基因识别模块还包括检验模块; 所述检验模块,其被配置为:针对某个第一分群,对过滤后的基因执行检验,得到p值,并对得到的p值进行校正后,对p值从小到大进行排序,选择排名靠前的若干个基因作为该第一分群的标记基因; 所述提取模块包括第二标记基因识别模块; 所述第二标记基因识别模块,其被配置为:对所有肿瘤浸润性T细胞数据进行聚类分群,得到若干个第二分群,并计算每个第二分群的标记基因; 对肿瘤浸润性T细胞再次进行聚类分群并计算每个第二分群的标记基因,其具体的技术路线和对单细胞数据进行聚类分群并计算每个第一分群的标记基因相同。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人南开大学,其通讯地址为:300071 天津市津南区海河教育园区同砚路38号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

以上内容由龙图腾AI智能生成。

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