安徽农业大学王浩宇获国家专利权
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龙图腾网获悉安徽农业大学申请的专利一种生物文本中酵母转录因子-基因关系抽取方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN116579427B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-03-17发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202310545817.6,技术领域涉及:G06N5/025;该发明授权一种生物文本中酵母转录因子-基因关系抽取方法是由王浩宇;吴云志;乐毅;冯成;丁杰;郁伟强;何思凡;张程设计研发完成,并于2023-05-12向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种生物文本中酵母转录因子-基因关系抽取方法在说明书摘要公布了:本发明公开了一种生物文本中酵母转录因子‑基因关系抽取方法,所述方法包括:检索与酵母转录‑基因关系抽取相关的文献;构建输入表示;构建关系抽取模型;将输入表示输入训练好的关系抽取模型,得到初步筛选的包含转录因子‑基因结合或调控信息的输出表示;将输出表示输入训练好的关系抽取模型得到第一概率,将输出表示分别输入句法分析器以及语义分析器以后输入图神经网络得到第二概率,设置损失函数进行二次训练,每次将实时采集的文献输入到模型中,最终根据第一概率和第二概率得到联合概率,联合概率大于预设值则视为输出表示中包含转录因子‑基因结合或调控信息,输出对应的输出表示;本发明的优点在于:关系抽取更为准确。
本发明授权一种生物文本中酵母转录因子-基因关系抽取方法在权利要求书中公布了:1.一种生物文本中酵母转录因子-基因关系抽取方法,其特征在于,所述方法包括: 步骤a:从生物医学文本数据库中检索与酵母转录-基因关系抽取相关的文献; 步骤b:对文献进行预处理,构建输入表示; 步骤c:构建关系抽取模型,训练该模型,得到训练好的关系抽取模型;所述关系抽取模型包括自注意力计算层、多头注意力层、第一线性层、激活层、第二线性层、归一化层、全连接层以及层,所述文献的输入表示输入自注意力计算层,将自注意力计算层的输出结果输入多头注意力层,自注意力计算层和多头注意力层的输出结果加权融合以后作为自注意力输出,自注意力输出输入第一线性层依次经激活层、第二线性层、归一化层、全连接层以及层,输出最终的输出表示; 步骤d:将输入表示输入训练好的关系抽取模型,得到初步筛选的包含转录因子-基因结合或调控信息的输出表示; 步骤e:将输出表示输入训练好的关系抽取模型进行分类得到表征输出表示中是否包含转录因子-基因结合或调控信息的第一概率,将输出表示分别输入句法分析器以及语义分析器以后输入图神经网络,再经过向量融合以及归一化操作,得到表征输出表示中是否包含转录因子-基因结合或调控信息的第二概率,设置损失函数进行二次训练,训练完成后,每次将实时采集的文献输入到模型中,最终根据第一概率和第二概率得到联合概率,联合概率大于预设值则视为输出表示中包含转录因子-基因结合或调控信息,输出对应的输出表示。
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