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浙江绍兴鼎晶生物医药科技股份有限公司胡欣获国家专利权

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龙图腾网获悉浙江绍兴鼎晶生物医药科技股份有限公司申请的专利三阴性乳腺癌肿瘤细胞通路分群方法、应用及系统获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN117219172B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-03-20发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202311010900.X,技术领域涉及:G16B40/00;该发明授权三阴性乳腺癌肿瘤细胞通路分群方法、应用及系统是由胡欣;韩香臣;韩博悦;杨闻萧;骆红;王鹏设计研发完成,并于2023-08-11向国家知识产权局提交的专利申请。

三阴性乳腺癌肿瘤细胞通路分群方法、应用及系统在说明书摘要公布了:本发明公开了一种三阴性乳腺癌细胞通路分群方法、应用及系统,该方法包括:获取多个目标样本的三阴性乳腺癌scRNA‑seq数据;对三阴性乳腺癌scRNA‑seq数据进行处理,获得目标肿瘤细胞的第一数据,对第一数据进行再次处理,得到单个目标肿瘤细胞的通路校正后富集分数;根据校正后富集分数,对目标肿瘤细胞进行分群,得到目标肿瘤细胞群;鉴定各个目标肿瘤细胞群的特征激活通路。通过该方法对三阴性乳腺癌肿瘤细胞进行分群,以获得不同基因通路表达模式的细胞群,并针对各群细胞的通路特征制定治疗方案,这对临床的个性化治疗和预后预测具有重要的参考价值。还公开了对应实施该方法的系统,以及该方法在寻找临床治疗靶点以及预测预后上的应用。

本发明授权三阴性乳腺癌肿瘤细胞通路分群方法、应用及系统在权利要求书中公布了:1.三阴性乳腺癌细胞通路分群方法,其特征在于,包括以下步骤: 获取多个目标样本的三阴性乳腺癌scRNA-seq数据; 对所述三阴性乳腺癌scRNA-seq数据进行处理,获得目标肿瘤细胞的第一数据,对所述第一数据进行再次处理,得到单个所述目标肿瘤细胞的通路校正后富集分数; 根据所述校正后富集分数,对所述目标肿瘤细胞进行分群,得到目标肿瘤细胞群; 鉴定各个目标肿瘤细胞群的特征激活通路; 所述获取多个目标样本的三阴性乳腺癌scRNA-seq数据,具体为: 获取多个目标样本的三阴性乳腺癌scRNA-seq数据,所述三阴性乳腺癌scRNA-seq数据为三阴性乳腺癌scRNA-seq基因表达矩阵; 所述对所述三阴性乳腺癌scRNA-seq数据进行处理,获得目标肿瘤细胞的第一数据,对所述第一数据进行处理,得到单个所述目标肿瘤细胞的通路校正后富集分数,包括以下步骤: 对所述三阴性乳腺癌scRNA-seq基因表达矩阵进行质量控制、数据过滤、数据合并、去除批次效应后,利用Garnett算法注释上皮细胞; 通过inferCNV算法评估所述上皮细胞的拷贝数变异,以区分正常上皮细胞与目标肿瘤细胞,提取肿瘤上皮细胞的第一数据;所述目标肿瘤细胞为肿瘤上皮细胞,所述第一数据为scRNA-seq基因表达矩阵; 对所述第一数据进行标准化,并将所述第一数据的基因表达值转换为排序; 从参考数据库中选取通路基因集,运用单细胞曼-惠特尼-威尔克森检验计算单个所述目标肿瘤细胞的各通路校正后富集分数; 所述对所述目标肿瘤细胞进行分群,得到目标肿瘤细胞群,包括以下步骤: 对每个所述目标样本进行一致性聚类,将每个目标样本分为多个亚群; 将所述亚群合并,并计算各个所述亚群之间的杰卡德距离; 根据所述杰卡德距离再次进行一致性聚类,通过CalinskyCriteria准则确定最佳聚类数,通过轮廓聚类检验聚类效果,将所述目标肿瘤细胞进行分群,得到目标肿瘤细胞群。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人浙江绍兴鼎晶生物医药科技股份有限公司,其通讯地址为:312000 浙江省绍兴市柯桥区齐贤街道西环路586号科创大厦A座19楼1901室;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

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