华中农业大学刘建晓获国家专利权
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龙图腾网获悉华中农业大学申请的专利融合完全动态卷积与CubeMLP的植物转录因子结合位点预测方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN120148607B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-03-20发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202510066044.2,技术领域涉及:G16B15/30;该发明授权融合完全动态卷积与CubeMLP的植物转录因子结合位点预测方法是由刘建晓;姚州;李可;丁新茹;杨尚坡设计研发完成,并于2025-01-16向国家知识产权局提交的专利申请。
本融合完全动态卷积与CubeMLP的植物转录因子结合位点预测方法在说明书摘要公布了:本发明提供了融合完全动态卷积与CubeMLP的植物转录因子结合位点预测方法,通过将测序得到的植物转录因子结合位点区域的DNA序列数据进行One‑hot编码处理和DNA双螺旋的空间结构特征提取;利用ODConv网络动态提取不同类别TFBS序列的模式特征,利用卷积神经网络提取DNA空间结构特征;利用CubeMLP从序列、模态和通道三个维度实现DNA序列特征模态和DNA空间结构模态特征的高效融合;利用全连接层和Sigmoid函数将融合特征的结果映射为不同类别的转录因子结合位点,进而实现不同类别转录因子绑定位点的识别;实现了预测转录因子结合位点的功能。本发明预测准确率高,为植物的转录因子的识别位点研究了提供新参考,具有广泛的应用前景。
本发明授权融合完全动态卷积与CubeMLP的植物转录因子结合位点预测方法在权利要求书中公布了:1.融合完全动态卷积与CubeMLP的植物转录因子结合位点预测方法,其特征在于:包括以下步骤: S1:对DNA序列数据进行数据划分和One-hot编码得到One-hot编码矩阵;采用蒙特卡洛模拟方法提取DNA空间结构特征得到DNA空间结构编码矩阵; S2:对One-hot编码矩阵,通过完全动态卷积网络的多维度注意力机制自适应调整卷积核权重,根据每类转录因子结合位点序列的特性提取DNA序列特征; S3:对DNA空间结构编码矩阵,利用卷积神经网络的卷积操作的权值共享特性提取DNA空间结构特征; S4:利用CubeMLP通过序列、模态和通道三个维度的MLP机制捕获跨模态特征的复杂空间交互关系,融合DNA序列特征与DNA空间结构特征的多模态特征; S5:将融合特征的结果映射为不同类别的转录因子结合位点,实现对不同转录因子结合位点特征的分类。
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