西安交通大学万金平获国家专利权
买专利卖专利找龙图腾,真高效! 查专利查商标用IPTOP,全免费!专利年费监控用IP管家,真方便!
龙图腾网获悉西安交通大学申请的专利一种三阴性乳腺癌预后基因标志物筛选的方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN114891887B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-03-24发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202210521515.0,技术领域涉及:C12Q1/6886;该发明授权一种三阴性乳腺癌预后基因标志物筛选的方法是由万金平;吴晓明;胡曦;宋佳霖;张虎勤;马欣越;王溢文;陶语漳;杜建强;李梓萌设计研发完成,并于2022-05-13向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种三阴性乳腺癌预后基因标志物筛选的方法在说明书摘要公布了:本发明公开了一种三阴性乳腺癌预后基因标志物筛选的方法,运用三阴性乳腺癌的基因表达数据,获取与细胞增殖标志物互作的基因,并借助单因素Cox回归来筛选预后相关基因,本发明利用最小最大凹惩罚的Cox回归方法构建预后风险评估模型,获得了能够预测和评估三阴性乳腺癌风险的预后基因标志物和预后评估方法。本发明中提出了针对高异质性疾病三阴性乳腺癌预后标志物基因识别技术,可在临床上运用推广。
本发明授权一种三阴性乳腺癌预后基因标志物筛选的方法在权利要求书中公布了:1.一种三阴性乳腺癌预后基因标志物筛选的方法,其特征在于,包括以下步骤: 1基因表达量的计算 利用序列比对BWA的MEM算法及对各转录本的FPKM归一化来表征三阴性乳腺癌患者样本的基因表达量,对这些基因表达量进行对数转换和标准化处理,并去除在所有样本中表达量低的基因; 2扩增标志物相互作用基因筛选 选用同常见扩增标志物相互作用的基因,扩增标志物选择MKI67基因,通过数据库查询获取与该标志物相互作用的其它基因,并提取这些基因的表达量数据,完成初步筛选,其中同MKI67相互作用的基因筛选是利用生物数据库BioGRID; 3预后基因标志物的筛选 选用单因素Cox回归作为单因素特征选择方法,进行预后基因的筛选;单因素Cox回归分析通过R语言的survival包中的coxph函数来实现,其中基因的p值筛选利用likelihood-p进行筛选;通过最小最大凹惩罚函数对单因素Cox回归选择的预后基因构建预后风险评估模型完成预后基因的进一步筛选,最小最大凹惩罚模型通过利用R语言程序中ncvreg包的cv.ncvsurv函数来完成;通过最小最大凹惩罚模型同时获得了预后基因标志物及预后基因标志物在预后风险评估模型中的系数; 对预后基因标志物的验证方法,通过预后基因标志物的系数及与其对应的基因表达量乘积在样本内的加和的方式构建预后风险评估公式,利用预后风险评估公式计算预后风险得分,判断每个患者的预后风险得分是否超过最佳分层截断值,对患者进行预后分层,最佳分层截断值的选取使用最佳截断值方法,当患者的预后风险得分小于等于最佳分层截断值时,病患被划分为预后低风险组,当患者的预后风险得分大于最佳分层截断值时,患者被划分为预后高风险组,根据预后高低风险组的分组情况对样本进行生存分析,当生存分析的P值小于0.05时,则说明筛选的预后基因标志物有效且与预后相关,所述最佳截断值通过survival包中的surv_cutpoint函数来实现,三阴性乳腺癌的转录组测序数据识别出对三阴性乳腺癌的细胞增殖以及预后有关的标志物,并利用标志物进行预后分层,通过生存分析验证预后分层的有效性。
如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人西安交通大学,其通讯地址为:710049 陕西省西安市咸宁西路28号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。
以上内容由龙图腾AI智能生成。
1、本报告根据公开、合法渠道获得相关数据和信息,力求客观、公正,但并不保证数据的最终完整性和准确性。
2、报告中的分析和结论仅反映本公司于发布本报告当日的职业理解,仅供参考使用,不能作为本公司承担任何法律责任的依据或者凭证。

皖公网安备 34010402703815号
请提出您的宝贵建议,有机会获取IP积分或其他奖励