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山东理工大学姜立波获国家专利权

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龙图腾网获悉山东理工大学申请的专利一种同源四倍体双减数参数与HWD系数的联合测定方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN116825194B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-03-24发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202310732188.8,技术领域涉及:G16B25/00;该发明授权一种同源四倍体双减数参数与HWD系数的联合测定方法是由姜立波;吕娟娟;吕忠璠;季东超;周健宣设计研发完成,并于2023-06-20向国家知识产权局提交的专利申请。

一种同源四倍体双减数参数与HWD系数的联合测定方法在说明书摘要公布了:本申请涉及同源四倍体生物领域,尤其涉及一种同源四倍体双减数参数与HWD系数的联合测定方法。包括:构建同源四倍体自然群体双减数与连锁不平衡联合模型;构建联合计算模型;输入双标记子代合子频率的实际数值至联合计算模型,确定双标记直亲代配子频率的估计数值;根据双标记直亲代配子频率的估计数值,计算单标记直亲代配子频率的估计数值;代入单标记直亲代配子频率的估计数值至单标记直亲代配子频率计算模型,得到非线性方程;根据非线性方程,确定双减数参数和哈迪‑温伯格不平衡系数的测定数值。本申请通过构建联合模型同时完成双减数频率估计、哈迪温伯格不平衡以及标记间连锁不平衡程度的测定,提高参数估计的精度。

本发明授权一种同源四倍体双减数参数与HWD系数的联合测定方法在权利要求书中公布了:1.一种同源四倍体双减数参数与HWD系数的联合测定方法,其特征在于,包括: S1:基于同源四倍体的哈迪-温伯格不平衡,确定考虑考虑双减数参数和HWD系数的单标记直亲代配子频率计算模型; 根据单标记直亲代配子频率计算模型,构建同源四倍体自然群体双减数与连锁不平衡联合模型; S2:基于对数似然函数,针对联合模型构建以双标记直亲代配子频率为参数并且以双标记子代合子频率为变量的联合计算模型; S3:获取自然群体中双标记子代合子频率的实际数值,以及输入双标记子代合子频率的实际数值至联合计算模型,基于EM算法确定联合计算模型中双标记直亲代配子频率的估计数值; 根据双标记直亲代配子频率的估计数值,计算单标记直亲代配子频率的估计数值; S4:代入单标记直亲代配子频率的估计数值至单标记直亲代配子频率计算模型,得到关于双减数参数和哈迪-温伯格不平衡系数的非线性方程; S5:针对非线性方程,依次进行基于Barzilai-Borwein步长的优化处理以及高斯消元法处理,相应地得到双减数参数和HWD系数的测定数值; 所述步骤S1包括: S11:基于哈迪-温伯格不平衡,构建关于自然群体的包括HWD系数的单标记远亲代配子频率分布公式; S12:根据单标记远亲代配子频率分布公式,确定单标记直亲代合子频率分布公式; S13:构建包括双减数参数的单标记直亲代配子频率分布公式; 代入所述单标记直亲代合子频率分布公式至单标记直亲代配子频率分布公式,相应地得到单标记直亲代配子频率计算模型; S14:基于同源四倍体的标记间连锁不平衡,根据单标记直亲代配子频率计算模型,构建同源四倍体自然群体双减数与连锁不平衡联合模型; 所述联合计算模型如下所示:; 式中,表示双标记直亲代配子频率; ,相应地表示双标记直亲代配子AABB,AABb,……,aabb; 表示双标记子代合子频率; ,表示标记SNP1的单标记直亲代配子AAAA,AAAa,……,aaaa; ,表示标记SNP2的单标记直亲代配子BBBB,BBBb,……,bbbb。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人山东理工大学,其通讯地址为:255000 山东省淄博市张店区新村西路266号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

以上内容由龙图腾AI智能生成。

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