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常州大学侯振杰获国家专利权

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龙图腾网获悉常州大学申请的专利基于异构子网融合多源特征miRNA疾病关联预测方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN116959553B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-03-24发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202310919381.2,技术领域涉及:G16B5/00;该发明授权基于异构子网融合多源特征miRNA疾病关联预测方法是由侯振杰;姚海滨;陈严;孙晓燕设计研发完成,并于2023-07-25向国家知识产权局提交的专利申请。

基于异构子网融合多源特征miRNA疾病关联预测方法在说明书摘要公布了:本发明涉及miRNA‑疾病技术领域,尤其涉及基于异构子网融合多源特征miRNA疾病关联预测方法,包括构建疾病相似性网络、miRNA相似性网络和miRNA疾病相互作用网络,利用RWR提取疾病拓扑结构特征向量和miRNA拓扑结构特征向量;对疾病‑miRNA关联矩阵进行非负矩阵分解;将疾病拓扑结构特征与miRNA低秩空间特征融合;将miRNA拓扑结构特征与疾病低秩空间特征融合;得到疾病和miRNA的异构子网;分别在miRNA的异构子网和疾病的异构子网上利用GCN进行节点嵌入后重构疾病‑miRNA关联。本发明解决现有方法在进行图嵌入前仅从相似性数据中获取特征,不能全面的反映疾病或miRNA的问题。

本发明授权基于异构子网融合多源特征miRNA疾病关联预测方法在权利要求书中公布了:1.基于异构子网融合多源特征miRNA疾病关联预测方法,其特征在于,包括以下步骤: 步骤一、通过多源信息构建疾病相似性网络、miRNA相似性网络和miRNA-疾病相互作用网络;利用随机游走算法RWR提取疾病拓扑结构特征向量和miRNA拓扑结构特征向量,并进行归一化得到疾病拓扑结构特征矩阵和miRNA拓扑结构特征矩阵; 步骤二、对疾病-miRNA关联矩阵进行非负矩阵分解,分别得到疾病和miRNA的低秩空间特征; 步骤三、将疾病拓扑结构特征与miRNA低秩空间特征融合;将miRNA拓扑结构特征与疾病低秩空间特征融合; 步骤四、结合疾病相似性网络、miRNA相似性网络以及疾病-miRNA相互作用网络划分得到疾病异构子网和miRNA的异构子网; 步骤五、分别在miRNA的异构子网和疾病的异构子网上利用GCN进行节点嵌入后重构疾病-miRNA关联; 步骤五具体包括: 步骤51、利用图卷积网络从miRNA子网来学习miRNA的初步嵌入; miRNA的初步嵌入的公式为: 22 其中,是的归一化后的邻接矩阵,是对角矩阵,为miRNA的异构子网;是系数矩阵,是一个偏置矩阵,是激活函数,为疾病拓扑结构特征与miRNA低秩空间特征融合后的特征矩阵; 同理,通过相同的嵌入过程,计算出疾病子网的初步嵌入; 步骤52、引入CRF层确保相似miRNA具有相似的嵌入,并采用自注意力机制来区分相邻节点对给定节点的贡献; miRNA的CRF层损失函数的公式为: 23 24 其中,表示从GCN卷积层获得节点的初步嵌入,表示在CRF层更新的节点的嵌入;表示节点之间的注意力得分,表示节点i的邻居,和是权重因子; 步骤53、重构疾病-miRNA关联矩阵和损失函数; 关联矩阵和损失函数的公式为: 28 29 其中,和分别为将表征投影回疾病和miRNA的原始特征的空间因素,为均方误差,和分别表示正样本和负样本的集合,和分别为miRNA和疾病的特征矩阵,为miRNA子网的ij节点; 步骤54、利用总损失函数计算miRNA整体损失; 总损失函数定义如下: 30 其中,为权重系数,为疾病-miRNA损失函数,为miRNA的CRF层损失函数,和为训练参数; 同理,在疾病子网中得到重构矩阵中的分数,将两个子网的分数进行融合得到最终的得分矩阵:; 最后,利用得分矩阵中的分数进行排序来预测新的疾病-miRNA关联。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人常州大学,其通讯地址为:213164 江苏省常州市武进区湖塘镇滆湖中路21号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

以上内容由龙图腾AI智能生成。

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