中国农业大学王宇占获国家专利权
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龙图腾网获悉中国农业大学申请的专利一种针对深度杂交系的祖源单倍型基因定位方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119724335B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-03-24发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202411804767.X,技术领域涉及:G16B20/00;该发明授权一种针对深度杂交系的祖源单倍型基因定位方法是由王宇占;赵毅强;卜李那设计研发完成,并于2024-12-10向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种针对深度杂交系的祖源单倍型基因定位方法在说明书摘要公布了:本发明属于生物信息技术领域,具体涉及一种针对深度杂交系的祖源单倍型基因定位方法。本申请通过获取待分析样本祖源基因型,进一步获得表型显著关联的基因组区段;之后再进行全基因组分析,与现有方法相比,本申请提供的针对深度杂交系的祖源单倍型基因定位方法,在有效降低假阳性的同时,还可用于杂种优势分析、捕获遗传标记间的显性及上位效应等。
本发明授权一种针对深度杂交系的祖源单倍型基因定位方法在权利要求书中公布了:1.一种针对深度杂交系的祖源单倍型基因定位方法,其特征在于,包括获取祖源基因型以及基因定位,其中,获取祖源基因型为:使用局部祖源推断工具,根据全基因组的固定框长划分待分析后代的全基因组为N个单倍型,并对单倍型进行编码推断其两祖先来源,获得全基因组祖源基因型;具体的,所述对单倍型进行编码推断两祖先来源为:令祖先1,祖先2分别用0,1表示;每个待分析后代样本的每个单倍型祖先来源可用0,1,2表示,又称为祖源基因型,表示二倍体动植物后代样本单倍型来自祖先1的拷贝数目;因此每个后代样本可按照单倍型顺序形成祖源单倍型向量,若干个后代样本形成祖源单倍型矩阵;其中,待分析后代单倍型0和2表示祖源纯合子,1表示祖源杂合子; 所述基因定位包括优亲和中亲杂种优势基因组区段定位,具体为:根据全基因组祖源基因型及矫正表型,使用非参数Kruskal-Wallis和Steel-Dwass检验分别进行优亲和中亲杂种优势检测,得到与表型显著相关的优亲和中亲杂种优势基因组区段; 所述基因定位包括上位互作基因组区段定位,具体为:根据全基因组祖源基因型及矫正表型,使用逻辑回归进行上位互作检测,并使用混合线性模型进行简单效应比较,检验基因型间互作显著性,得到与表型显著相关的上位互作基因组区段; 其中,将待分析表型中固定效应扣除后的残差作为所述矫正表型。
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