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中国海洋大学张伟鹏获国家专利权

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龙图腾网获悉中国海洋大学申请的专利一种海洋噬菌体抗菌溶素预测方法、装置、介质和设备获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN120260696B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-03-24发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202510327813.X,技术领域涉及:G16B40/20;该发明授权一种海洋噬菌体抗菌溶素预测方法、装置、介质和设备是由张伟鹏;卞越杰设计研发完成,并于2025-03-19向国家知识产权局提交的专利申请。

一种海洋噬菌体抗菌溶素预测方法、装置、介质和设备在说明书摘要公布了:本发明公开了一种海洋噬菌体抗菌溶素预测方法、装置、介质和设备,涉及生物医药和计算生物学领域。包括:基于全球已知抗菌蛋白序列构建训练数据集;利用抗菌蛋白数据集训练基于深度学习的蛋白质序列分类模型,获得海洋抗菌溶素预测模型。对待预测噬菌体蛋白序列进行数据标准化处理后输入到蛋白语言模型中,通过ProtT5模块对输入序列进行自注意力建模,提取全局结构和功能相关特征,获得第一特征向量;通过ProtBERT模块提取短序列局部依赖特征,获得第二特征向量;对第一、第二特征向量进行加权求和生成融合特征向量;对融合特征向量进行概率预测,输出待预测海洋噬菌体序列的抗菌标签及预测置信度。

本发明授权一种海洋噬菌体抗菌溶素预测方法、装置、介质和设备在权利要求书中公布了:1.一种海洋噬菌体抗菌溶素预测方法,其特征在于,包括: 构建包括ProtT5模块、ProtBERT模块、加权模块和分类模块的深度学习网络,基于所采集的抗菌蛋白序列数据构建数据集,使用数据集对构建的深度学习网络进行训练,获得海洋噬菌体抗菌溶素预测模型; 将待预测海洋噬菌体抗菌溶素序列输入到预测模型中,通过ProtT5模块对待预测海洋噬菌体抗菌溶素序列进行编码和解码操作,以捕捉待预测海洋噬菌体抗菌溶素序列中的全局特征,获得第一特征向量;通过ProtBERT模块对待预测海洋噬菌体抗菌溶素序列进行编码操作,以捕捉待预测海洋噬菌体抗菌溶素序列中的序列局部依赖关系,获得第二特征向量;通过加权模块对第一特征向量和第二特征向量进行加权求和,获得融合特征向量;通过分类模块对融合特征向量进行概率预测,输出待预测海洋噬菌体蛋白序列为抗菌蛋白序列的置信度; 所述通过ProtT5模块对待预测海洋噬菌体抗菌溶素序列进行编码和解码操作,具体包括: 在ProtT5的编码阶段:通过ProtT5模块中的位置编码层对待预测海洋噬菌体抗菌溶素序列进行位置编码,结合蛋白序列嵌入操作,获得蛋白质序列嵌入向量;通过ProtT5模块中的多头自注意力机制层捕捉蛋白质序列嵌入向量的全局依赖关系,生成上下文加权蛋白序列向量;通过ProtT5模块中的第一前馈神经网络层对加权蛋白序列向量进行非线性变换,并结合残差连接和归一化操作,获得蛋白质编码特征; 在ProtT5的解码阶段,通过ProtT5模块中的序列重建层对蛋白质编码特征进行序列重建,输出生成预测氨基酸序列向量;通过ProtT5模块中的掩码多头自注意力机制层对氨基酸序列向量进行掩码操作,以捕捉氨基酸的局部依赖关系,获得氨基酸掩码加权向量;通过ProtT5模块中的交互注意力机制层,计算蛋白质编码特征和氨基酸掩码加权向量之间的全局依赖关系,获得融合加权氨基酸序列向量;通过ProtT5模块中的第二前馈神经网络层对融合加权氨基酸序列向量进行非线性变换,并结合残差连接和归一化操作,获得第一特征向量; 所述通过ProtBERT模块对待预测海洋噬菌体抗菌溶素序列进行编码操作,具体包括: 通过ProtBERT模块中的位置编码层对待预测海洋噬菌体抗菌溶素序列对齐至预设的固定长度后进行位置编码,结合蛋白序列嵌入操作,获得蛋白质序列嵌入向量; 通过ProtBERT模块中的多头自注意力层对蛋白质序列嵌入向量进行加权,以捕捉氨基酸的全局依赖关系,获得加权蛋白序列向量; 通过ProtBERT模块中的掩码语言建模层对加权蛋白序列向量进行随机掩盖,生成氨基酸掩码特征; 通过ProtBERT模块中的池化层对氨基酸掩码特征进行特征聚合,获得第二特征向量。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人中国海洋大学,其通讯地址为:266000 山东省青岛市崂山区香港东路23号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

以上内容由龙图腾AI智能生成。

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