博德生物技术(德州)有限公司隗希昱获国家专利权
买专利卖专利找龙图腾,真高效! 查专利查商标用IPTOP,全免费!专利年费监控用IP管家,真方便!
龙图腾网获悉博德生物技术(德州)有限公司申请的专利一种计算生物学研究数据分析展示方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN120432018B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-03-24发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202510592559.6,技术领域涉及:G16B45/00;该发明授权一种计算生物学研究数据分析展示方法是由隗希昱设计研发完成,并于2025-05-09向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种计算生物学研究数据分析展示方法在说明书摘要公布了:本发明涉及生物学研究数据分析技术领域,公开了一种计算生物学研究数据分析展示方法,包括从生物组织或细胞中提取总RNA,将RNA逆转录为cDNA,构建文库,并利用高通量测序平台对文库进行测序,以获得大量的短序列。本发明通过对映射至相同基因组坐标区间内短序列的数量进行比对和阈值判断,能够有效识别出异常的重复区域,从而明确判断基因表达差异结果是否可信,当异常序列数量超出预设的重复序列阈值时,通过消除重复序列的影响操作,即针对FPKM值较高的情况去除完全相同且重叠的短序列,并重新比对更新结果,能够校正因重复计入导致的表达量失真问题。
本发明授权一种计算生物学研究数据分析展示方法在权利要求书中公布了:1.一种计算生物学研究数据分析展示方法,其特征在于,所述方法包括如下步骤: 从生物组织或细胞中提取总RNA,将RNA逆转录为cDNA,构建文库,并利用高通量测序平台对文库进行测序,以获得大量的短序列; 对短序列数据进行预处理,通过FastQC工具对原始数据检测样本中测序数据的质量分数分布、GC含量、序列重复情况以及可能的测序偏差,对接头污染和低质量区域进行识别并剔除,将剩余短序列数据标记为可用序列; 对可用序列数据进行标准化,得到其FPKM值,建立参考基因组,并得到参考基因组的FPKM值,将可用序列与参考基因组的FPKM值求差,得到基因表达差异结果; 通过基因表达差异结果得到结果差异幅度,并设定差异幅度阈值,当结果差异幅度小于或等于差异幅度阈值时,将此次基因表达差异结果标记为数据差异分析结果;当结果差异幅度大于差异幅度阈值时,将执行重复序列区域判断策略,用于在可用序列中存在较多重复序列时执行消除重复序列影响操作,以得到更新差异结果并将其标记为数据差异分析结果,通过可视化表达数据差异分析结果,以实现数据展示; 执行消除重复序列影响操作具体是:判断可用序列的FPKM值和参考基因组的FPKM值的大小结果,当可用序列的FPKM值大于参考基因组的FPKM值时,将同一重复区域内完全相同且重叠的短序列去除,并重新将可用序列与参考基因组进行比对,通过可用序列与参考基因组的FPKM值求差得到更新差异结果,将其标记为数据差异分析结果并进行可视化表达;当可用序列的FPKM值小于参考基因组的FPKM值时,应判断获得的基因表达差异结果可信,将其标记为数据差异分析结果,并进行后续的可视化表达; 当可用序列的FPKM值小于参考基因组的FPKM值时,执行个体差异判断,以用于判断样本的基因组中否存在个体变异,执行个体差异判断的方式是:将可用序列与参考基因组中的参考序列进行对比,以获取可用序列与参考基因组中的参考序列的最大相似度,并设定相似度阈值,将最大相似度与相似度阈值进行大小比较,以执行个体差异判断,将最大相似度小于相似度阈值的可用序列标记为变异序列,统计变异序列总数,设定变异数量阈值,根据变异序列总数和变异数量阈值的大小比较做出相应反应; 若变异序列总数小于变异数量阈值,则判断获得的基因表达差异结果可信,将其标记为数据差异分析结果,并进行后续的可视化表达;若变异序列总数大于等于变异数量阈值,则判断此次样本的基因组出现个体变异现象,将因过滤而漏录的短序列依据其数量在现有数据基础上进行添加,并重新将可用序列与参考基因组进行比对,通过可用序列与参考基因组的FPKM值求差得到更新差异结果,将其标记为数据差异分析结果并进行可视化表达。
如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人博德生物技术(德州)有限公司,其通讯地址为:253084 山东省德州市经济开发区袁桥镇崇德八大道3230号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。
以上内容由龙图腾AI智能生成。
1、本报告根据公开、合法渠道获得相关数据和信息,力求客观、公正,但并不保证数据的最终完整性和准确性。
2、报告中的分析和结论仅反映本公司于发布本报告当日的职业理解,仅供参考使用,不能作为本公司承担任何法律责任的依据或者凭证。

皖公网安备 34010402703815号
请提出您的宝贵建议,有机会获取IP积分或其他奖励