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龙图腾网获悉中国海洋大学申请的专利一种有性生殖动物种系突变率的测量方法及应用获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN121171342B 。

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-03-24发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202511316518.0，技术领域涉及：G16B20/50；该发明授权一种有性生殖动物种系突变率的测量方法及应用是由陈夕;孙进设计研发完成，并于2025-09-16向国家知识产权局提交的专利申请。

本一种有性生殖动物种系突变率的测量方法及应用在说明书摘要公布了：本发明提供了一种测量有性生殖动物全基因组水平核苷酸种系突变率的方法。所述方法包括以下步骤：1对待测物种进行基因组测序，得到待测物种的所有编码蛋白的序列；2构建待测物种的系统发育树；3获取待测物种与近缘种之间的分歧时间Tdivergence；4优化待测物种的系统发育树；5获取待测物种的年种系突变率μyear。所述方法的原理为：基因组中广泛分布中性区域或中性位点，这些位置产生的突变通常不受自然选择的影响；通过分析这些位点的变异频率随时间的变化，可以计算种系突变率。本申请所述的方法，不仅广泛适用于已获得基因组或转录组数据的有性生殖动物物种，而且准确、高效，填补了现有技术的空白，对于理论研究和生物医学工程的实际应用均有具有要的意义。

本发明授权一种有性生殖动物种系突变率的测量方法及应用在权利要求书中公布了：1.一种测量有性生殖动物年种系突变率的方法，其特征在于：包括以下步骤： 1对待测物种进行基因组测序，得到待测物种的所有编码蛋白的序列； 2构建待测物种的系统发育树：选取4-8个待测物种的近缘种，获取待测物种与所有近缘种共有的单拷贝同源基因；将单拷贝同源基因的氨基酸序列对齐，并据此将其对应的核苷酸序列对齐；然后将单拷贝同源基因的核苷酸序列串联，使用最大似然法构建得到待测物种与近缘种的系统发育树； 3获取待测物种与近缘种之间的分歧时间Tdivergence：利用校准时间节点，使用系统发育软件中的松弛分子钟法，结合核苷酸替代模型，获取步骤2构建的系统发育树中目标物种与近缘种之间的分歧时间Tdivergence 4优化待测物种的系统发育树：利用单拷贝同源基因中的四倍简并位点，优化步骤2构建的系统发育树，得到优化后的系统发育树；由此得到待测物种的分支长度Dspecies，以及与待测物种亲缘关系最接近的近缘种的分支长度Dphylogenetic 5获取待测物种的年种系突变率μyear ①如目标物种与所选亲缘关系最近的物种分歧时间小于5Mya，目标物种的年种系突变率μyear采用Eq.1计算公式得到 Eq.1； 其中，k为同源假基因序列分歧度，θπ为目标物种核苷酸多态性； ②如目标物种与所选亲缘关系最近的物种分歧时间介于5~20Mya之内，目标物种的年种系突变率μyear采用Eq.2计算公式得到； Eq.2； ③如目标物种与亲缘关系最近的物种分歧时间介于20~200Mya，目标物种的年种系突变率采用Eq.3计算公式得到， Eq.3； 其中，Ksmid为待测物种与步骤2构建的系统发育树中亲缘关系最近的近缘种之间的所有同源单拷贝基因的同义替换数的中位数。

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