上海交通大学陈杰获国家专利权
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龙图腾网获悉上海交通大学申请的专利高密度样品基因测序方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN115985392B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-03-31发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202310051198.5,技术领域涉及:G16B20/30;该发明授权高密度样品基因测序方法是由陈杰;孙嘉伟;邵志峰;沈玉梅;孙洁林;李小卫;程酩;沈轶设计研发完成,并于2023-02-02向国家知识产权局提交的专利申请。
本高密度样品基因测序方法在说明书摘要公布了:一种高密度样品基因测序方法,通过分别采集按二维点阵排列的高密度测序样品的A、C、T、G四通道荧光采集图像各一次并确定每个荧光信号的衍射斑中心位置,从而计算得到样品点阵的整体空间位置分布并确定每一个样品点在成像时单独存在信号情况下的荧光信号计算图像,再根据该荧光信号图像对耦合图像进行解耦,得到每个样品点的信号强度,通过对每一样品点在每一次成像时不同波长通道的信号强度分析,确定每一样品点中核酸的碱基排布顺序。本发明在现有测序仪器的基础上,最小可以将样品分布间距减小到成像系统分辨率的0.45倍,且保持读取错误率为万分之一。缩小样品间距到成像系统分辨率的0.36倍,保持错误率为千分之一。
本发明授权高密度样品基因测序方法在权利要求书中公布了:1.一种高密度样品基因测序方法,其特征在于,通过分别采集按二维点阵排列的高密度测序样品的A、C、T、G四通道荧光采集图像各一次并确定每个荧光信号的衍射斑中心位置,从而计算得到样品点阵的整体空间位置分布并确定每一个样品点在成像时单独存在信号情况下的荧光信号计算图像,再根据该荧光信号图像对耦合图像进行解耦,得到每个样品点的信号强度,通过对每一样品点在每一次成像时不同波长通道的信号强度分析,确定每一样品点中核酸的碱基排布顺序; 所述的高密度是指:当测序样品的密度大时,不同的碱基信号会耦合在一起,对测序结果产生影响; 所述的每个荧光信号的衍射斑中心位置,通过以下方式得到:对有序列信息相关联的荧光信号的耦合宽场图像进行预处理,然后通过计算图像局部极大值点并经阈值筛选得到若干待定拟合的像素点,再利用高斯分布函数拟合衍射斑的点扩散函数从而得到各衍射斑的位置坐标以及衍射斑的大小,通过反复地拟合图像中各候选点,对比单个样品点产生的衍射斑的大小,过滤掉多个样品点耦合的衍射斑的中心位置,得到一系列位置的坐标; 所述的解耦是指:根据衍射斑中心位置估计视野中第一个点的位置,从而生成测序样品的空间分布的基坐标矩阵A,利用正交匹配追踪算法来优化问题,其中:y是四通道荧光采集图像,A为基坐标矩阵,x为最终计算得到的点阵各位置信号的强度,求得各个坐标下的分量即样品对应点的信号强度。
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