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深圳华大基因科技服务有限公司林宏获国家专利权

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龙图腾网获悉深圳华大基因科技服务有限公司申请的专利一种FASTQ文件的拆分方法、系统、电子设备及存储介质获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN116050348B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-03-31发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202310104014.7,技术领域涉及:G06F40/103;该发明授权一种FASTQ文件的拆分方法、系统、电子设备及存储介质是由林宏;石明明设计研发完成,并于2023-01-16向国家知识产权局提交的专利申请。

一种FASTQ文件的拆分方法、系统、电子设备及存储介质在说明书摘要公布了:本发明涉及一种FASTQ文件的拆分方法、系统、电子设备及存储介质,该拆分方法包括:以barcodeindex序列为键、样品ID为值构建表一;以barcodeindex序列为键、barcodeindex序列所属FASTQ文件的序号及其在所属FASTQ文件中的位置信息为值构建表二;对表一中的各组barcodeindex序列进行分段、错配碱基替换以及合并处理后生成新的序列,以新的序列为键、样品ID为值构建表三;构建表四包括:输出文件的序号、对应输入FASTQ文件序号、该文件输出序列的起始位置和长度;以每4行为一条序列,同时遍历各个FASTQ文件,基于表一、表二、表三和表四对每个单位序列进行拆分,解决现有技术中缺少一种通用的拆分方案的问题。

本发明授权一种FASTQ文件的拆分方法、系统、电子设备及存储介质在权利要求书中公布了:1.一种FASTQ文件的拆分方法,其特征在于,所述拆分方法包括: 以barcodeindex序列为键、样品ID为值构建表一; 以barcodeindex序列为键、所述barcodeindex序列所属FASTQ文件的序号及其在所述所属FASTQ文件中的位置信息为值构建表二; 对所述表一中的各组barcodeindex序列进行分段、错配碱基替换以及合并处理后生成新的序列,以新的序列为键、样品ID为值构建表三; 构建表四包括:输出文件的序号、对应输入FASTQ文件序号、该FASTQ文件输出序列的起始位置和长度; 以每4行为一条序列,同时遍历各个FASTQ文件,基于所述表一、表二、表三和表四对每个单位序列进行拆分; 所述基于所述表一、表二、表三和表四对每个单位序列进行拆分的过程包括: 遍历所述表二中的每个barcodeindex序列的编号,根据所述表二的键值对应关系获取所述单位序列所属FASTQ文件的序号及其在所述所属FASTQ文件中的位置信息,获取所述所属FASTQ文件中位置信息对应的序列并记为序列四; 根据所述表二中的barcodeindex序列的编号顺序,根据所述表一中的指定连接符将所述序列四连接为字符串并记为序列五;以所述序列五为键,基于所述表三获取样品ID; 根据所述表四的所属FASTQ文件的序号及其在所述所属FASTQ文件中的位置信息,获取所述所属FASTQ文件中所述单位序列的位置信息对应的序列并记为序列六,基于所述表四中的输出文件的序号输出所述序列六和对应的样品ID。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人深圳华大基因科技服务有限公司,其通讯地址为:518000 广东省深圳市盐田区盐田街道洪安三街21号华大综合园7栋1010;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

以上内容由龙图腾AI智能生成。

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