之江实验室杨耀东获国家专利权
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龙图腾网获悉之江实验室申请的专利一种基于蒙特卡洛树搜索的多目标分子生成方法和装置获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN117594156B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-04-03发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202311496788.5,技术领域涉及:G16C20/50;该发明授权一种基于蒙特卡洛树搜索的多目标分子生成方法和装置是由杨耀东;陈广勇;李蓝青;李金鹏;张昊天;王二成;王平安设计研发完成,并于2023-11-10向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种基于蒙特卡洛树搜索的多目标分子生成方法和装置在说明书摘要公布了:本发明公开了一种基于蒙特卡洛树搜索的多目标分子生成方法和装置,属于基于靶点的分子生成领域,包括:基于已知的蛋白质序列和分子碎片,以及用户多目标属性需求,本发明采用构建蒙特卡洛树的方式,依次将满足用户需求且亲和力强的原子符号拼接到分子碎片之后,最后得到的完整的分子再通过化学工具分析属性,得到分子的评估值,其中包含了用户对于分子的多目标属性的需求,再将构建起来的非支配的分子加入全局帕累托集合中,用于构建用户需要的分子。本发明采用蒙特卡洛树搜索算法,同时提出多目标选择标准,实现了用户指定的多目标属性的分子生成,具有简单易行、快速有效且搜索效率高的优势。
本发明授权一种基于蒙特卡洛树搜索的多目标分子生成方法和装置在权利要求书中公布了:1.一种基于蒙特卡洛树搜索的多目标分子生成方法,其特征在于,包括以下步骤: 步骤1:将分子碎片作为蒙特卡洛树的根节点,设定强亲和力阈值; 步骤2:将分子碎片和蛋白质序列输入预训练的自回归模型,得到第一概率及其对应的第一层原子符号,根据第一概率计算多目标选择标准,将多目标选择标准大于强亲和力阈值的第一层原子符号作为叶节点,分别拼接到分子碎片后,得到第一层分子碎片; 步骤3:分别将第一层分子碎片和蛋白质序列输入预训练的自回归模型,得到第二概率及其对应的第二层原子符号,根据第二概率计算多目标选择标准,将多目标选择标准大于强亲和力阈值的第二层原子符号作为叶节点,分别拼接到第一层分子碎片后,得到第二层分子碎片; 步骤4:重复步骤2和步骤3,将分子的评估值反向更新得到叶节点的评估值,辅助多目标选择标准,迭代更新至满足终止条件;依据分子的评估值将非支配的分子加入全局帕累托集合,得到满足用户需求的多目标分子; 其中,所述依据分子的评估值将非支配的分子加入全局帕累托集合,包括: 将新生成的分子对应的评估值与全局帕累托集合中的已有分子对应的评估值进行比较,如果新生成的分子对应的评估值高于全局帕累托集合中的已有分子对应的评估值,则新生成的分子为非支配的分子,将新生成的分子加入全局帕累托集合,同时从全局帕累托集合中移除被新生成的分子支配的分子。
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