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上海交通大学袁野获国家专利权

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龙图腾网获悉上海交通大学申请的专利基于反义链多维度嵌入表征的siRNA抑制率预测方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN116844644B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-04-14发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202310832533.5,技术领域涉及:G16B40/00;该发明授权基于反义链多维度嵌入表征的siRNA抑制率预测方法是由袁野;刘斌设计研发完成,并于2023-07-08向国家知识产权局提交的专利申请。

基于反义链多维度嵌入表征的siRNA抑制率预测方法在说明书摘要公布了:一种基于反义链多维度嵌入表征的siRNA抑制率预测方法,在离线阶段通过构建深度神经网络并采用针对siRNA的反义链序列构建多维度特征进行训练,在在线阶段给定靶基因名称,获取全部候选siRNA序列,并采用训练后的深度神经网络对实时输入的候选siRNA序列进行沉默效率预测和排序。本发明对于siRNA的反义链序列,利用独热编码和预训练RNA‑FM模型的嵌入表示特征作为输入,以深度神经网络的方式构建siRNA抑制率预测模型,提高预测的有效性和精确性,并将其与基因表达序列搜索算法融合,构建了从靶基因名称输入到筛选高效siRNA序列的完整流程。

本发明授权基于反义链多维度嵌入表征的siRNA抑制率预测方法在权利要求书中公布了:1.一种基于反义链多维度嵌入表征的siRNA抑制率预测方法,其特征在于,在离线阶段通过构建深度神经网络并采用针对siRNA的反义链序列构建多维度特征进行训练,在在线阶段给定靶基因名称,获取全部候选siRNA序列,并采用训练后的深度神经网络对实时输入的候选siRNA序列进行沉默效率预测和排序; 所述的多维度特征,通过以下方式得到:采集若干异源数据集中的核苷酸信息后,分别针对siRNA的反义链AS进行One-hot独热编码以及利用预训练的RNA-FM模型对反义链进行嵌入表征;针对AS序列计算候选二级结构;针对AS序列统计不同位置上不同碱基出现的频率,得到位置特异性打分矩阵、单核苷酸频率、双核苷酸频率、三核苷酸频率、GC碱基含量和GC连续碱基片段长度比率、整条AS核心片段的Gibbs自由能之和,以及5’和3’两端的Gibbs自由能之差。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人上海交通大学,其通讯地址为:200240 上海市闵行区东川路800号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

以上内容由龙图腾AI智能生成。

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