香港理工大学姚钟平获国家专利权
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龙图腾网获悉香港理工大学申请的专利根据串联质谱法对数据编码肽进行测序获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN116895335B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-04-14发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202310375584.X,技术领域涉及:G16B40/10;该发明授权根据串联质谱法对数据编码肽进行测序是由姚钟平;伍卓知;刘重明;谭伟文设计研发完成,并于2023-04-10向国家知识产权局提交的专利申请。
本根据串联质谱法对数据编码肽进行测序在说明书摘要公布了:肽测序在解码存储在数据编码肽中的数据中很重要。串联质谱MSMS对于肽测序特别有用。在用于根据实验谱对数据编码肽进行测序的计算机实现方法中,首先对实验谱的原始数据进行预处理,以去除不可解释的峰,从而产生预处理数据。从谱图中识别竞争所述肽的肽序列的一个或多个候选序列的第一集合。所述谱图是根据预处理数据而不是原始数据形成的,以产生较少数量的候选序列,从而减少测序的时间成本。然后处理第一候选序列集合,以估计所述肽序列,从而获得肽序列估计序列的集合。验证每个估计序列是否无效。清理肽序列估计序列的集合以去除任何无效估计序列。
本发明授权根据串联质谱法对数据编码肽进行测序在权利要求书中公布了:1.一种用于根据实验谱对数据编码肽进行测序的计算机实现方法,所述实验谱的原始数据是最初在通过质谱法对数据编码肽进行分析中获得的强度对质荷比的直方图的数据,所述方法包括: 对原始数据进行预处理,以去除不可解释的峰,从而产生预处理数据; 从谱图中识别竞争所述肽的肽序列的一个或多个候选序列的第一集合,其中所述谱图是根据预处理数据而不是原始数据形成的,以产生较少数量的候选序列,从而减少测序的时间成本; 处理第一候选序列集合,以估计所述肽序列; 在获得所述肽序列的一个或多个估计序列的集合后,验证各个肽序列估计序列是否无效;以及 清理所述肽序列的一个或多个估计序列的集合,以去除任何发现的无效的肽序列估计序列, 其中,所述对原始数据进行预处理以产生预处理数据包括: 将原始数据的质荷比集合分成多个子集,从而使每一个子集由数据编码肽的片段的同位素的质荷比组成,各个质荷比在所述实验谱中具有信号峰,而所述片段的同位素具有相同的正整数值电荷; 计算各个子集的片段的单同位素质量; 根据原始数据和各个子集中的质荷比计算片段的强度;以及 生成预处理数据,其中: 所述预处理数据包括多个质量和多个强度,其中所述多个质量是由各个子集的片段的单同位素质量形成的,并且其中各个质量与相应的强度相关联;并且 所述预处理数据还包括实验谱的推定的b离子的第一质量集合和推定的y离子的第二质量集合,其中所述第一质量集合和所述第二质量集合是通过将所述多个质量中的相应质量分布到第一质量集合和第二质量集合中产生的, 其中,从所述谱图识别第一候选序列集合包括以下步骤: a按照各个质量的相应强度的降序对所述多个质量进行排序,从而形成有序质量序列,其中所述有序质量序列对所述多个质量进行排名,其中排名最高的质量与最高的相应强度相关联; b给定所述有序质量序列中的选定质量和较高排名的质量的选定数量,在所述谱图中识别一个或多个基于最高强度的标签,其中各个基于最高强度的标签是由具有选定质量的第一个氨基酸和多个分别具有从选定数量的较高排名的质量中选择的质量的其余氨基酸组成的部分序列; c处理所述一个或多个基于最高强度的标签,其中处理各个基于最高强度的标签包括: 确定各个基于最高强度的标签的前缀和后缀; 若成功确定了前缀和后缀,则组合所述前缀、所述各个基于最高强度的标签和所述后缀,以形成新的候选序列;以及 将所述新的候选序列分配给第一候选序列集合; d按顺序使用严格递减的值序列中的连续值作为较高排名的质量的选定数量来重复步骤b和c,直到第一候选序列集合不为空或者严格递减的所述序列被用尽;以及 e从排名最高的质量开始,按顺序使用所述有序质量序列中的连续质量作为选定质量来重复步骤b-d,直到第一候选序列集合不为空或者在所述有序质量序列中达到预选数量的较高排名的质量。
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