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上海百英生物科技股份有限公司常留平获国家专利权

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龙图腾网获悉上海百英生物科技股份有限公司申请的专利一种基于膨胀卷积与通道注意力机制进行抗体-抗原结合可能性的预测的方法和模型及其应用获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN121506235B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-04-14发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202610043176.8,技术领域涉及:G16B15/30;该发明授权一种基于膨胀卷积与通道注意力机制进行抗体-抗原结合可能性的预测的方法和模型及其应用是由常留平;卢海松;郗焕磊;杨宇星设计研发完成,并于2026-01-14向国家知识产权局提交的专利申请。

一种基于膨胀卷积与通道注意力机制进行抗体-抗原结合可能性的预测的方法和模型及其应用在说明书摘要公布了:本发明属于生物医药领域,提供了一种基于膨胀卷积与通道注意力机制进行抗体‑抗原结合可能性的预测的方法和模型及其应用。所述方法基于膨胀卷积与通道注意力机制进行抗体‑抗原结合可能性预测,通过收集训练数据集构建深度学习模型,在训练中引入膨胀卷积以扩展感受野,并结合通道注意力机制增强特征表达能力从而实现高效预测。本发明通过膨胀卷积有效扩大感受野以捕获长程序列依赖,结合通道注意力机制自适应强化关键特征,在有限标注数据条件下显著提升预测准确率,可广泛应用于抗体筛选、药物设计及免疫治疗等领域。

本发明授权一种基于膨胀卷积与通道注意力机制进行抗体-抗原结合可能性的预测的方法和模型及其应用在权利要求书中公布了:1.一种基于膨胀卷积与通道注意力机制进行抗体-抗原结合可能性的预测的方法,其特征在于,所述方法包括: 1数据预处理步骤:获取抗体重链氨基酸序列、轻链氨基酸序列及抗原的氨基酸序列,对所述氨基酸序列进行编码,将氨基酸序列转化为固定长度的one-hot特征矩阵; 2特征提取步骤:将所述one-hot特征矩阵分别输入至编码器,所述编码器由若干膨胀卷积模块顺序堆叠组成;经膨胀卷积后输出的矩阵,采用残差连接与随机失活增强特征传递并防止过拟合; 3注意力加权和特征聚合步骤:对所述特征提取步骤处理后的矩阵应用通道注意力机制,进行注意力加权以增强特征表达,输出通道权重向量,将权重向量与原始特征逐通道相乘;对经注意力加权后的重链、轻链与抗原三个编码分支输出的特征图分别进行全局池化,获得定长特征向量,随后将三者拼接形成融合特征表示,形成统一的融合特征矩阵,为后续分类预测提供输入; 4分类预测步骤:对所述融合特征矩阵进行分类预测,输出抗体与抗原结合可能性的预测值; 5模型训练与优化步骤:获取正负样本数据作为训练集与验证集,所述正样本数据是指能够与抗原结合的抗体序列,负样本数据是指不能与抗原结合的抗体序列;基于标注的正负样本数据,采用交叉熵损失函数与优化器进行训练,在验证集准确率与损失率满足预设条件时保存模型参数,所述预设条件为当验证准确率大于或等于历史最优值且验证损失小于或等于历史最小值时,保存当前模型参数作为最优模型参数; 所述数据预处理步骤中,采用one-hot编码方式将氨基酸序列数字化表示,其中每个氨基酸被转化为长度为20的独热向量,对应20种标准氨基酸;为保证输入维度一致,对不足长度的序列进行填充至统一长度;经编码与填充后,单条序列被表示为由多个氨基酸的特征向量构成的二维特征矩阵;多条经编码与填充的序列可按批次形式组合为模型输入特征,用于后续的特征提取与学习。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人上海百英生物科技股份有限公司,其通讯地址为:201318 上海市浦东新区周浦镇沈梅路99弄1-9号1幢101、106、201、301、401室;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

以上内容由龙图腾AI智能生成。

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