吉林大学第一医院易星丞获国家专利权
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龙图腾网获悉吉林大学第一医院申请的专利基于基因调控网络的单细胞肿瘤微环境数据分析方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN116246713B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-04-21发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202310296417.6,技术领域涉及:G16B40/30;该发明授权基于基因调控网络的单细胞肿瘤微环境数据分析方法是由易星丞;戴云;靳凤艳;兰茂卓;潘晓强;孙月;李佳佳;张丽娟设计研发完成,并于2023-03-24向国家知识产权局提交的专利申请。
本基于基因调控网络的单细胞肿瘤微环境数据分析方法在说明书摘要公布了:本发明公开了一种基于基因调控网络的单细胞肿瘤微环境数据分析方法,包括以下步骤:获取若干个细胞的原始数据值,并进行预处理和特征基因识别;基于获得的特征基因之间的调控关系,构建Degree基因表征矩阵,并识别细胞亚群;对所述细胞亚群进行细胞熵的分析、差异Degree基因的识别以及基因功能富集的分析。本发明通过SCILE算法以每一基因在每一细胞中基因调控网络的重要程度评估细胞整体的干性熵值,相比于传统基于表达量的评估方法,本方法避免因高表达低调控基因对于细胞干性的影响。
本发明授权基于基因调控网络的单细胞肿瘤微环境数据分析方法在权利要求书中公布了:1.一种基于基因调控网络的单细胞肿瘤微环境数据分析方法,其特征在于,包括以下步骤: 获取若干个细胞的原始数据值,并进行预处理和特征基因识别; 基于获得的特征基因之间的调控关系,构建Degree基因表征矩阵,并识别细胞亚群; 对所述细胞亚群进行细胞熵的分析、差异Degree基因的识别以及基因功能富集的分析; 构建Degree基因表征矩阵的过程包括:基于CSN算法构建单样本基因调控网络获取每个特征基因之间的调控关系,进而基于PCA算法对所述特征基因进行整体降维,并通过Degree算法对每个特征基因进行表征,获得Degree基因表征矩阵; 识别细胞亚群的过程包括:将所述Degree基因表征矩阵作为背景数据,基于SNN算法进行无监督聚类识别关键细胞亚群; 对所述细胞亚群进行细胞熵分析的过程包括:将所述Degree基因表征矩阵作为背景数据,基于SCILE算法获得不同细胞亚群细胞熵值; 对所述细胞亚群进行差异Degree基因识别的过程包括:基于wilcox检验算法获取所述特征基因的log2FC和p值,预设|log2FC|0.25amp;,p0.05的阈值识别差异Degree基因;其中,所述p值为wilcox检验分析校验值; 进行基因功能富集分析的过程包括:基于enrichGO对每一细胞亚群中的差异Degree基因进行GO富集分析。
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